青花菜采收后不耐贮藏，由于其食用的部分为幼嫩的花茎，花薹和花蕾，故呼吸强度高，采收后室温下1～2天，花球变松散发黄，品质下降，0～5℃的低温下，可保鲜7天左右，故青花菜采收后，应及时处理或销售，忌堆积时间过长。

如需暂时贮存，0℃为贮藏适温，为防止叶绿素分解，可用水焯后冷藏，即可保持色泽翠绿，又食用方便，可贮藏4天左右不变色，超过4天后，Vc的含量显著降低，风味变差。

青花菜作外销时，需按出口要求，花球直径12～15厘米，花茎长14厘米，单个花球重250克以上，精选后包装，包装可用60厘米×32厘米×30厘米的纸板箱，箱内衬入0．04毫米的聚乙烯塑料袋。花球装入后扎口密封，并打两个大小适当的孔，每箱装菜10千克，青花菜包装前需经预冷，贮藏适温为0℃，相对湿度为95%；气调贮藏：可用10%的CO2和1%的O2，在5℃下气调贮藏能延长新鲜青花菜的货架期。