给正在花期的君子兰种兰授粉，是君子兰有性繁殖十分重要的技术环节。给君子兰授粉就是将雄蕊花粉抹到雌蕊柱头上的过程。这个过程既包括异株之间授粉，又包括本株自花授粉。
　　当花粉来源充足时，可用镊子直接将父本雄蕊折断，然后镊住雄蕊的花丝，直接将花粉抹到母本雌蕊的柱头上，授粉就完成了。在花粉来源较少时，为使有限的花粉充分利用，可打开用锡纸储存的花粉，用针尖粘上后，轻点在雌蕊的柱头上，授粉即完成。
　　君子兰花授粉后，花瓣逐渐脱落，成功受精的子房便会膨大，未成功的子房变为黄软。受精成功的种子经过7至9个月，果实由绿变黄或红，用手捏时会发出沙沙的响声，这说明种子已经成熟，可以采收了。要想提高君子兰授粉的成功率，需要注意以下几个方面。
　　一是把握授粉时机。待花朵完全打开、雌蕊柱头已有分泌物时（花朵打开两天左右）即可授粉。另外，为保证授粉成功，在花粉充足时也可在授粉后的第二天进行补授。
　　二是掌握授粉时间。每天上午9点至11点和下午2点至4点，阳光适中，空气干湿度好，是授粉的最佳时间。
　　三是明确授粉季节。因君子兰花开大都在1月至5月，盛花期为2月至3月，所以这段时间是给君子兰授粉的最好季节。5月份以后授粉，因气温升高，君子兰即将进入休眠期，坐果率会下降甚至不坐果，因此一般不再给君子兰授粉。
　　四是做好授粉标记。给君子兰授粉后要标明授粉时间、父本名称，以备查询品系来源和为今后研究留下记录。
　　五是提倡科学育种。给君子兰授粉的目的是为了繁殖出优良植株。因此，选择怎样的父本、母本十分关键。要深刻把握君子兰的遗传规律，特别是孟德尔的分离与组合规律，不断提高育种的科学性。