(3)
臭氧熏蒸
把种蛋放在密闭空间内，当臭氧浓度达到O.01％时具有良好的杀菌力，该方法的缺点是速度慢，时间长。
(4)
过氧乙酸熏蒸
每立方米用160％的过氧乙酸50mL，高锰酸钾5g，熏蒸15分钟，可快速、有效杀死大部分病原体。需要注意的是，过氧乙酸腐蚀性较强，而且高温易引起爆炸。
种蛋消毒完后应马上放到蛋库中保存，防止再次受到污染。
四
种蛋的保存
1
种蛋保存的温度
对肉种鸡而言，种蛋孵化的适宜温度为37.5℃～37.8℃，但是当温度超过23.9℃，胚胎就开始发育，种蛋产出前就已经是发育了的多细胞胚胎，产出体外后会暂时停止发育，如果环境温度忽高忽低，胚胎数次发育又数次停止，胚胎就会死亡或活力减弱。种蛋产下后应使其温度降至低于胚胎发育的阈值温度，一直保存到种蛋入孵前为止。
如果种蛋贮存期为一周，要求种蛋库的温度15℃～18℃；一周以上时，则蛋库温度应在12℃～15℃。种蛋保存期间应保持温度的相对叵定，最忌温度忽高忽低。
2
种蛋保存的湿度
种蛋保存期间蛋内水分通过气孔不断蒸发，蒸发的速度与周围环境湿度有关，环境湿度越高蛋内水分蒸发越慢，但湿度过大，会引起盛放种蛋的蛋盘和纸箱吸水变软，严重者导致发霉。种蛋库的相对湿度一般要求75％～80％，可大大减慢蛋内水分的蒸发速度。
3
种蛋贮存时间实验表明，在15℃～18℃的贮存条件下，种蛋贮存5天之内对孵化率和雏鸡质量无明显影响，但是超过7天孵化率会明显下降，超过2周的种蛋孵化价值就不大了。如果要保存2周以上的时间，需要进一步降低种蛋贮存的温度，而孵化率也会明显降低，见表2。
即使种蛋贮存条件很好，经过贮存的种蛋受精率和孵化率也会随着贮存时间的延长而降低。随着种蛋保存时间的延长，孵化时间延长，种蛋每多保存一天，孵化时间延长0.5～1h，而且雏鸡质量也会降低。
如果种蛋需要保存较长时间，可将种蛋装在密封的塑料袋内，充满氮气后保存，这样可以减少袋内氧气含量，减缓蛋内物质和微生物的代谢，防止蛋内水分蒸发。研究表明，用这种方法保存21天的种蛋，孵化率仍能达到75％～80％。
4
种蛋保存期间的其他注意事项
(1)
种蛋放置的位置
一般要求种蛋贮存期间大头向上，小头向下，这样有利于种蛋存放和孵化出雏。
(2)
转蛋
如果种蛋保存时间不超过1周，在储存期间不用转蛋。若保存2周时间，在储存期间需要每天将种蛋翻转90度，以防止系带松弛、蛋黄贴壳。
(3)
种蛋上的水汽凝结
当种蛋由冷库向温度高的地方转运时，水蒸气会凝集到蛋壳上，形成水滴，俗称“冒汗”。种蛋“冒汗”不仅不利于操作，而且容易受细菌污染。注意更不能用甲醛熏蒸有水汽的种蛋。