肉牛新品种选育
良种黄牛肉用新品系选育 在鲁西黄牛、秦川黄牛和南阳黄牛的候选基础群中，以生长速度、体型、抗逆性为指标，制定基础群多目标选择指数，将生长速度快、体型大、抗逆性好的鲁西黄牛、秦川黄牛和南阳黄牛的个体选择出来，组建相应的新品系；选育基础群采用开放式核心群选育法，培育良种肉牛新品系；以24月龄体重和眼肌面积两个指标制定综合育种值选择指数，参考产奶量，并结合生长速度、肉质、抗逆性等遗传标记进行辅助选择，利用动物模型BLUP法进行遗传评定，培育出优质、耐粗饲肉牛新品系。
引进良种、专门化肉用品种选育 以现有引进的国外肉牛品种个体组建基础群，以18月龄体重和大理石花纹两个指标制定综合育种值选择指数，采用开放式核心群选育法进行本品种选育，并结合生长速度、大理石花纹、嫩度等遗传标记进行辅助选择；使用动物模型BLUP法进行遗传评定；采用胚胎移植技术快速繁育优良个体，选育我国肉用牛新品种。
肉牛育种生产性能测定方法的研究及其标准化 超声波技术应用于大理石花纹和眼肌面积的测定，研究不同体尺性状、大理石花纹、眼肌面积与体重、屠宰率、净肉率之间的相关性，构建数学模型，以便研制科学合理、操作方便、准确性高的测定规程和性能记录系统，降低育种成本，由此制定出标准化肉牛育种生产性能测定体系。
良种肉牛繁育体系建设和肉牛联合遗传评估体系的建立 形成各品系核心育种群，统一遗传评估方法，加快联合育种体系建设，促进良种肉牛繁育体系建设；研究不同品种肉牛主要经济性状的遗传变异参数估计方法以及肉牛标记辅助EPD估计方法，建立肉牛遗传改良联合数据库，形成肉牛多品种遗传评估体系。
肉牛分子育种技术创新体系研究 以开放核心群育种体系、MOET育种方案及基因、分子遗传标记辅助选择等技术为主导，应用现代育种规划理论进行动态模型最优化育种方案筛选和公牛繁育体系的最优化研究，并利用分子数量遗传学理论预测杂种优势。
杂种优势利用与优质高效肉牛杂交组合的筛选 应用遗传学、基因组学和生物信息学技术，研究肉牛杂种优势模式，建立肉牛杂种优势利用技术平台，包括分子标记预测、数量遗传学、杂交育种和软件分析技术等；以培育的鲁西黄牛、秦川黄牛和南阳黄牛专门化肉用牛新品系为母本，利用引进的优质肉牛品种为父本，筛选出优质高效肉牛杂交组合进行商品肉牛生产。
肉牛健康养殖
优势肉牛产区的高效、抗逆肉牛杂交组合或配套系筛选 利用我国中原肉牛优势产区和东北肉牛优势产区现有的地方品种鲁西牛、草原红牛等和引进的国外良种肉牛品种利木赞牛、西门塔尔牛、夏洛来牛等为基础群，利用常规育种技术和超声波活体测膘技术，结合分子生物技术，在中原、东北肉牛优势产区进行优质、抗逆性肉牛杂交组合或配套系的筛选。
功能性牛肉生产配套技术体系研究 研究不同日粮和专用饲料添加剂对肉牛瘤胃中共扼亚油酸合成代谢的调控规律以及对牛肉中共扼亚油酸含量的影响；研究建立富含共轭亚油酸功能型牛肉的检测与评价技术；研究不同的肉牛杂交组合、日粮成分、饲料添加剂及饲养管理方式对牛肉胆固醇含量的影响；研究中草药添加剂等营养调控型添加剂对牛肉品质的影响；研制小牛肉的高档优质功能性牛肉专用生产配套技术。
肉牛胴体质量与产量评价体系研究 以我国中原肉牛优势产区和东北肉牛优势产区不同品种的肉牛胴体为实验对象，研究肉牛胴体质量与产量常规评测定指标体系与分级标准，以及关键评测定指标快捷精准评测定技术和分级标准，制定由活牛出栏评价体系、胴体质量评价体系和牛肉质量评价体系为主构成的肉牛胴体质量体系。
肉牛健康养殖技术体系研究 根据中原、东北肉牛带的气候地理特点和饲料资源状况，研制适合不同地区特点的肉牛绿色无公害专用饲料，研究粗饲料均衡供应技术、肉牛营养调控技术、营养成分监控技术和“清洁”饲养技术、肉牛良种高效扩繁技术、肉牛高效饲养技术、肉牛场疫病综合防控技术、药物残留控制技术和粪尿无害化综合处理与利用技术等组装，确立肉牛健康养殖技术体系。
存在的问题
近年来，我国肉牛业发展迅速，但无论是与肉牛业发达国家相比，还是与肉牛业进入新阶段的需求相比，肉牛的改良工作仍然存在一些问题。