如果饮水免疫方法不当，则起不到应有的效果，甚至造成不必要的损失。鸡的饲养量大时， 采用饮水法免疫比注射法方便、省事， 同时减少对鸡群的应激刺激，在采用饮水免疫时应注意以下几个问题。
1. 在鸡雏尚未学会饮水时不应在饮水中放入免疫疫苗。此时应用饮水免疫易造成用量不均。
2.在鸡群患病期间， 或者营养缺乏等健康状况不佳时，不要采用饮水法。此时应用饮水法免疫易造成鸡只死亡。
3.夏季在饮水免疫前2小时，冬季在饮水免疫前4 小时要停止给水，使鸡群产生一定的渴感。 以便将水及时饮净，防止因疫苗在水中时间过长降低效果。同时应注意停水时间不能过长，以防止鸡过度缺水。
4.饮水器具要清洁、无污物， 不要用金属饮水器，最好用塑料或木质饮水器。 对于使用时间较长的木质饮水器要用刷子多刷几遍，残留的食物、 残渣等一定要清除干净。
5.要有足够的饮水器具， 确保每只鸡都同时有足够的饮水空间。 这样可以避免有的鸡因体质弱而得不到足够的饮水。 直到所有有疫苗的水饮完以后才能添加正常饮用水。
6.禁止饮水器具上带有任何消毒剂、清洗剂。 用清洗剂清洗的饮水器具在使用前应用清水多次冲洗， 以避免饮水器具上残留的消毒剂、 清洗剂杀死免疫用的病毒而造成免疫失败。
7.在饮水免疫的前3天不搞鸡群消毒，同时在饲料中应添加倍量多种维生素，尤其是VA、VC、VE。接种前 24小时的饮水内不要有预防治疗药物或消毒剂。
8.饮水免疫用水最好使用蒸馏水。 农村的深井水也可以，但绝对不可直接使用自来水。可在每升水中加 50毫升脱脂奶或加1％～2％的脱脂奶粉， 待充分混合均匀后再加疫苗。脱脂奶有保护疫苗作用。
9.不同日龄的鸡饮水免疫时的饮水剂量也有所不同，一般采用下面的剂量：4日龄至3周龄的鸡5～10升 /1000头份；3～8周龄的鸡20升/1000头份；8周龄以上的鸡 40升/1000头份。
10.在饮水免疫后要保证鸡群有个安静舒适的环境，减少外界环境中不良因素如噪音等对鸡群的刺激。 应激会增加鸡的不良反应，影响免疫效果。
11.在饮水免疫结束后第一天内饲料中不要添加抗生素等药物。饮水中也不要有任何添加剂。
12.在实际生产上为取得较好的免疫效果常常采用二次免疫法，即在早晨给鸡群进行免疫后再停一段时间水(时间要比初次短，一般在0.5～1小时之间) 然后再进行第二次饮水免疫，用量要减少。
13. 在一天中早晨进行饮水免疫取得的效果比别的时间要好。水要用冷水，避免使用温水或热水。 开放式鸡舍要避免阳光直接照射，以免病毒被杀死。