(一)饮水消毒的重要性和目的 饮水是鸡群疾病传播的一个重要途径。病鸡可通过饮水系统将致病的病毒或细菌传给健康的鸡，从而引发呼吸系统、消化系统疾病。如果在饮水中加入适量的消毒药物可以杀死水中带有的细菌和病毒。饮水消毒主要可控制大肠杆菌、沙门氏菌、葡萄球菌、支原体及一些病毒性病原微生物。同时对控制饮水系统中的粘液细菌也极为有效。
(二)饮水消毒中消毒剂的选用 饮水消毒可以选择的消毒剂种类很多，常用的有氯制剂、复合季铵盐类等。消毒药可以直接加入蓄水池或水箱中，用药量应以最远端饮水器或水槽中的有效浓度达到该类消毒药的最适饮水浓度为宜。
(三)饮水消毒应注意的事项 (1)高浓度的氯可引起鸡腹泻，生产力下降，尤其在雏鸡阶段不能用超过10x10（的负6次方）的氯制剂饮水。而且氯对霉菌无作用，如果鸡只发生嗉囊霉菌病时，需在水中加碘消毒，浓度为12x10（的负6次方）。(2)在饮水免疫、滴口免疫及喷雾免疫的前后2天，或饮水中加入其他有配伍禁忌的药物时，应暂停饮水消毒。除此之外，饮水消毒在整个饲养期不应间断。