但是，目前活菌制剂的就用还存在着以下一些问题：（1）细菌失活导致微生物饲料添加剂制作过程中的培养条亻、机械、干燥、分装、保存等因素，饲料加工中的高温、机械、制粒等因素降低了其生物活性作用：（2） 在菌类筛选上，需要建设找出更多具有直接促生长作用的良性微生物，并考虑其安全性、长效性、多效性、广泛性、高效性和针对性；（3）除乳酸杆、双歧杆菌外，其他制剂在肠道和作用机制尚不十分清楚。

3 展望

微生态学是门新兴的科学，其研究成果大大促进了微生态制剂的研究应用，研究微生态制剂的作用机制仍然是一个重点，而微生态工程以及对正常菌群中的菌株进行遗传修饰发开发新的更加有效的微生态制剂，或对已有的微生态制剂的菌种进行遗传改造，以扩大菌种的底物范围，提高其代谢活性是今后研究的方向和难点。