事实上，我国自上世纪70年代起以长江中下游为核心开展小麦赤霉病系统研究，在长江中下游麦区育成了丰产性好且较抗赤霉病的“宁麦”和“扬麦”系列小麦品种，部分抗源在美国抗小麦赤霉病育种中起到了关键作用，我国抗赤霉病育种成得到了国际上的普遍认可。近年来，随着耕作制度和气候的变化，赤霉病的暴发性流行更为突出，在赤霉病暴发的2012年，黄淮麦区的品种几乎全部是高感品种，发病严重，药效微弱;长江中下游的中感到中抗的品种发病也较重，但药效明显;而“苏麦3号”等抗源不打药仍可过关。因此，为了解决长江中下游及黄淮南片小麦主产区赤霉病问题，保障我国粮食安全，促进小麦产业发展，进行区域性协作开展抗小麦赤霉病育种工作刻不容缓。以研究基础较好的长江下游育种单位为主，结合全国其他主要麦区有良好育种基础条件的单位进行区域性协作开展抗小麦赤霉病育种工作，目标是培育出高产优质且赤霉病抗性显着改良的小麦新品种。
　　玉米：高产、优质、多抗、专用……统筹兼顾
　　北京市农林科学院玉米研究中心主任、农业部玉米专家指导组组长赵久然
　　良种在玉米增产中的贡献率约占40%，发挥着至关重要的作用，因此，未来的玉米育种应该针对这些生产和市场中的突出问题，从遗传改良的途径，为玉米的高产高效、节本增效、提质提效、资源高效以及节水节肥节药和环境友好的可发持续生产目标提供科技支撑和增加科技贡献率。
　　总体育种目标仍应是高产、优质、多抗、广适、易制种。育种的过程是一个不断改良优化、不断超越已有、不断聚合优良性状的过程。一个品种要成为能够在生产上大面积推广，让广大农民认可接受的有市场竞争力的品种，需要经受多种环境条件和生产条件的检验和考验，因此必须应具备高产、优质、多抗、广适、易制种等多方面综合优点。任何片面地强调或夸张某一个特点而不及其余，都是经不起生产实践考验的。
　　早熟、耐密、适宜机收籽粒是未来玉米育种的主导目标之一。为降低劳动力成本，提高劳动生产效率，实施全程机械化特别是机械直接收获籽粒成为必然趋势。因此在具备高产、优质、多抗、广适、易制种等综合优点基础上，特别要突出熟期适宜、耐密抗倒、脱水快、适宜机收籽粒等特点。机械直收籽粒在欧美等国家早已实现，我国黑龙江农垦和新疆兵团农场也已经大面积实施，近两年在东华北春玉米区和黄淮海夏玉米区也开始试验示范。但机收籽粒需要适宜的品种、收获机械、烘干仓储甚至包括种植模式等多方面条件和配套，切勿盲目跟风，一哄而上。适宜籽粒机收的品种主要有三方面的要求，首先是要抗倒伏，不但前期抗倒，生理成熟后也要抗倒，总的倒伏倒折率在5%以下;第二是后期脱水速度快，在适宜收获期内含水率应降到25%以下，黄淮海夏玉米可适当放宽标准;第三是仍要有较高的产量水平，比主栽对照增产或产量水平相当等。同时在全程机械化生产中还需要种子的发芽率高、活力高等指标，符合单粒精量播种和一播全苗的生产需求。此外，现在和将来使用苗后除草剂越来越普遍，伴随的是生产上除草剂药害普遍发生，给玉米生产带来很大影响，因此选育耐除草剂品种也已成为当务之急。
　　符合“一控两减、资源高效利用”的需求目标是大趋势并呈常态化。为了实现生态环保、环境友好的可持续发展以及节本增效目标需求，玉米育种更应着重选育耐干旱和水分生产利用效率高的品种;耐低氮、耐瘠薄，肥料利用效率高的品种;抗多种病、虫害，农药使用量尽量少的品种。
　　加强鲜食玉米和青贮玉米等专用玉米品种的选育。鲜食玉米需要在具备综合优点基础上更加突出品质，特别是食用品质和口感、风味等，此外增强其功能营养品质如维生素A、E和叶酸等可以增加其价值潜力。还有一项重要指标是适采期和货架期，应尽量延长其长度。同时在籽粒颜色、熟期、穗型、粒型等方面需要满足市场多样化需求。
　　青贮玉米育种除了像普通大田玉米那样要求高产稳产、多抗广适以外，更特别要求生物产量高、饲用品质好、制种产量高等。