害虫在长期的化学农药防治条件下，会产生抗药性，不合理使用生物农药同样能产生抗药性。笔者经过长期的大田应用和室内试验，观察到细菌性生物农药Bt(苏云金杆菌)也易产生抗性，其中小菜蛾抗药性高达540倍以上，菜青虫达148倍，棉铃虫达102倍。 
　　 随着生物农药的使用量和次数不断增加，害虫对生物农药的抗药性将逐步显露出来。害虫对生物农药抗性的发展除本身遗传因素和生物特性外，不合理的使用方法也易造成抗性直线上升。因此，要想延缓害虫耐生物农药的抗性，首先不能认为生物农药是万能的，一味追求生物农药的使用，更不能用它代替其他农药。如果在蔬菜生产中，1年使用生物农药8-9次，就易给小菜蛾、菜青虫创造产生抗性的有利条件。 
　　　 如何减少害虫对生物农药Bt的抗药性。笔者认为应注意以下几点： 
　　　 一、在多雨地区，1季允许使用2次左右；在干旱地区(平均年降雨量600毫升左右，最高年份为800毫升，最低年份为300毫升)，以1熟1次为宜。防治蔬菜小菜蛾，Bt农药春季使用2次左右，夏季1次，秋季2次。超过2次防效不佳，必须更换其他生物农药，必要时采用低毒化学农药。 
　　　 二、微生物杀虫剂、植物性农药主要以胃毒触杀作用防治害虫，使用时温度、湿度、光照、风雨及水条件较严格。如在江苏地区Bt最佳防治温度为25-34摄氏度，真菌球孢白僵菌25摄氏度左右，布氏白僵菌防治蚧螬、蝼蛄为23-25摄氏度。另外，对湿度、日照及施药时间也要严格控制。 
　　　 三、害虫对生物农药产生抗性后，可以与一些化学农药混配。如低毒酯类的化学农药，以提高其防效，但切忌与有机磷类农药混配。 
　　　 四、Bt农药以液体状储存时，pH值调至4.6左右。 
　　　 五、可适当加入多功能氧化酶的抑制剂作为生物保护剂，可提高药效，减少用量和延缓抗性发展。 
　　　 六、应采用综合防治措施，把生物、物理、农业防治和化学防治相结合，合理控制农药的使用量和次数，以保持农产品的生产安全。