但在8月推出最终版本时，第三十五条有明确提示――“转基因农作物种子生产、经营许可规定，由农业部另行制定”，之前“征求意见稿”相关转基因的规定都已被删除。

　　由于现在农业部审定育繁推一体化种子企业的标准是根据《农作物种子生产经营许可管理办法》，所以本次农业部颁发的种子生产经营许可证与转基因无关。目前这些规模上亿元的种子企业主要是生产经营杂交玉米和杂交水稻品种，有一些大型种子企业虽然也在加快研究转基因玉米、水稻的研究，但距离“生产经营许可证”还很远。

　　而从投入资金的力度上看，国家对转基因技术的支持还在加大，今年国家面向种子企业的生物育种能力及产业化专项投资是3.4亿元。目前农业部方面正在加紧修改《种子工程建设规划(2011-2015年)》、《全国现代农作物种业发展规划(2011-2020年)》，这两个“规划”中都有涉及转基因的内容，按照农业部指定的种业扶持政策出台时间表，这两个种业发展规划都将在年内正式颁布。

　　事实上，早在2010年，农业部就组织专家着手制定上述两个“规划”，原计划出台的时间都是在去年，但其间由于在转基因等方面争议较大，相关转基因的部分经过多次修改，使得两个种业发展规划的颁布时间被推延至今年年底。