“十一五”期间，四子王旗把新型农村合作医疗作为为民办实事的重要工作来抓，逐步完善了新型农村牧区合作医疗制度。
该旗通过不断调整和修订合方案，降低起付线，提高封顶线和报销比例，使农牧民看病难、看病贵的问题有所缓解。把更多的农牧民覆盖到合的保障范围之内，随着财政补助的大幅增加，参合农牧民受益程度逐步提高，农牧民不再完全由自己承担疾病经济风险，医疗负担有所减轻，因病致贫、因病返贫的情况有所缓解。
调查显示，农牧民以往小病拖、大病扛的现象已得到极大改善。特别是今年以来，该旗农牧业户籍人口15.03万人，以户为单位参合14.59万人，参合率为97.07％,为38535名参合农牧民建立了基本信息，合作医疗实现了常住人口的全覆盖。同时，取消了个人家庭账户，实行了门诊统筹，筹集资金1750.284万元，截止11月底,有33187人次获得了医疗费用补偿，补偿费用总计1488.16万元，占年应筹资总额的85％。其中：住院补偿6725人次计1331.28万元、门诊补偿26462人次计156.88万元。另外，为提高农村医疗机构服务条件和服务能力，四子王旗对全旗11所乡镇卫生院、120个村卫生室的房屋和设备等基础设施进行投入并对卫生专业技术人员进行培训，为新型农村牧区合作医疗工作的开展奠定了坚实的基础。尤其是从2010年3月份实行基本药物零加价以来，乡镇卫生院门诊、住院人次上升，有效拉动了基层医疗卫生机构的发展。