西瓜栽培中最重要病害之一是枯萎病，从幼苗期至结果期均可发生，尤以重茬地发病率更为重要，一般减产20%～50%，重者绝收。为了解决这一难题，近年来大面积推广了西瓜嫁接栽培技术，取得了较好的效果。但在生产中仍有部分嫁接后的西瓜植株发生枯萎病害，发病率达10%以上。通过调查得知，有些生产者缺乏对枯萎病传播途径的认识，某些属于技术环节处理不当所致。归纳起来，有以下几种原因，应在栽培技术中加以改进。
　　1.嫁接后发病原因
　　1.1种子带菌
　　西瓜枯萎病系尖镰孢菌侵染造成。病菌厚垣孢子可黏于种子表皮上越冬，带病种子播种出苗后，若条件适宜即可侵入植株体内潜伏，定植后发病为害。
　　1.2营养困二（苗床土）带菌
　　枯萎病菌是以菌丝、厚垣孢子和菌核随病株残体在土壤中或未腐熟的有机肥中越冬，存活长达6年，成为翌年主要侵染源。育接穗苗时，多数营养土来自农家肥和园田土或大田土混合而成，致使营养土（苗床土）带病菌而直接侵入幼苗体内，遇适宜条件即发病。
　　1.3砧木选择不当
　　目前西瓜生产中常用嫁接砧木有西砧1号、瓠瓜1号、菜葫芦、小籽瓠瓜、中国南瓜等，其中西砧1号和瓠瓜1号属于高抗砧木，多年优势不减。但有的瓜农图省钱用自产的葫芦、小籽瓠瓜作砧木，由于抗病性差，枯萎病时有发生，也可能产生新的生理小种所致。还有用中国南瓜嫁接，田间出现20%～30%的共生不亲合株，表现黄萎、叶形变小、卷叶和蔓短等病症。
　　1.4断接穗根过晚
　　为了提高嫁接成活率，多数瓜农把砧木、接穗种子播同一营养钵内，采取“两条腿”贴接或舌接方法，待定植成活后才断去接穗根，给嫁接苗感病创造了机遇。
　　1.5嫁接伤口触地
　　有的瓜农即使选用高抗砧木，进行种子和营养土消毒，及时断接穗根，但在西瓜生产中期，仍发生病害。经调查，凡发病株，嫁接口处接触土壤、埋入土中或用土暗压蔓，反之极少有病。因为土传病害主要由根部伤口或根毛顶端侵入的。而嫁接苗由于断接穗根时留茬长、定植深、高培土、暗压蔓等原因，使接穗重新生根，为病菌侵入创造良好环境而发病。