苗木产业是焉耆县的一个传统优势产业、富民产业，截止2014年底，育苗面积13676亩，其中新育7453亩，产苗量15339万株，苗木产业合作社12家。
　　近年来，在焉耆县林业部门的大力支持下，新品种的引进、新技术的应用和规模化、标准化生产得到了长足发展。全县苗木产业以七个星镇、良种场为主，苗木主要销往南北疆及内地，营销格局已初步形成。
　　2015年，焉耆县林业局按照《焉耆县苗木产业发展规划》，召开专题研究部署苗木产业，要求充分发挥我县常规造林育苗优势，实现种苗产业由面积扩张向提质增效转变，重点要以常规苗木为主，并发展附加值高的风景绿化苗木，丰富绿化苗木品种和规格。同时群策群力，重点解决苗木销售问题，加大宣传力度，扩宽苗木销售渠道，创造公平的市场竞争环境，促进和保障林木种苗事业持续健康发展。