一是茶园管理较粗放，基地精品园缺乏。由于近年来基地建设主要着力于规模的扩大，由于从业技术人员和资金短缺，相关科技知识在茶园管理上的应用薄弱，茶树施肥技术、茶园机采技术、病虫害的生物防治技术等知识还没有在茶园培管上普及，管理比较粗放，基地建设中“精品园”缺乏。
　　二是生产加工机械化程度低，产品结构不合理。当前茶农采摘鲜叶主要为手工，加工多为半自动生产线，劳动效率低下。另外加工出来的产品仅为绿茶、红茶，且多生产春茶，价格高，适合大众消费质优价廉的红茶、夏秋茶产品和产量均不多，产品结构不合理。
　　三是质量安全体系建设薄弱，全面监管实施难度大。目前，县域有茶叶生产加工企业（合作社）共44家，规模和经济实力不一，其中仅5家获得QS食品生产许可证，要对产地环境、投入品使用、生产过程、产品质量全程监控，落实茶叶生产、加工、包装、销售各环节的质量监管责任，杜绝不合格鲜叶进入加工、不合格产品进入市场的全面实施难度大。
　　四是品牌建设资金缺乏，市场知名度不高。保靖黄金茶虽然历史悠久，但仅在省内小有名气，由于前期产业建设的大量资金都投入到基地建设上，而且品牌建设在近几年才起步，加上县本级财政困难，在品牌建设上投入的资金甚少，造成品牌建设投入资金与实际需求之间差距大，客观上滞后于基地建设。
　　五是专业人才资源缺乏，茶文化氛围不浓。产业的科研、品种选育、技术推广、企业管理等专业人才稀缺，乡镇、村级茶叶产业服务机构尚未健立，导致一些基础性的试验、示范工作全面开展难度大，生产管理过程中精细化程度不高。此外茶文化方面人才的缺乏，目前将保靖黄金茶与本土的苗族文化结合起来的研究还处于起步阶段，造成整体茶文化氛围不浓，产业链条不完整。