中国湿地资源十分丰富，但由于过去政府对湿地环境功能和生态效益认识不足，使得在湿地利用过程中出现盲目开垦、过度开发和忽视保护等一系列问题，导致湿地面积日益减少、污染加剧、功能和效益低下及生物多样性丧失， 湿地生态系统遭到破坏，“地球之肾”日渐衰竭。到目前为止，中国湿地资源存在的主要问题主要体现在以下几个方面。

1.湿地面积日渐萎缩

从20世纪中期开始，中国天然湿地面积急剧缩小。统计数据显示，近40 年来，沿海地区累计丧失滨海滩涂湿地面积约11万hm²，加上城乡工矿占用湿地约100万hm²，两项就相当于沿海湿地总面积的50%;全国湖泊围垦面积累达130万hm²以上，已超过五大淡水湖面积之和；江汉平原的湿地面积已由新中国成立初期的500万hm²减至目前的不足110万hm²；号称千湖之省的湖北，湖泊面积由原来的83万hm²减至目前的24万hm²。

湿地资源消失如此之快，其原因是多方面的：

①围海造地，致使沿海滩涂湿地急剧减少，是中国沿海湿地减少的重要原因。自20世纪50年代以来，中国海岸全线开展围海造地工程。至20世纪80 年代末，全国围垦海岸湿地达119万hm²，其中81%改造成农田，19%用于盐业生产。除此之外，另有100万hm²海岸湿地被作为城乡工矿用地，两项合计200万hm²以上，相当于沿海湿地总面积的50%。

②盲目开垦和改造，使大量天然湿地转变成农用耕地或城市建设用地，是造成内陆地区天然湿地面积萎缩的主要原因。以长江中下游地区为例，1949年本区湖泊总面积为25 828 km²，由于围湖造田，大量修建垸、圩等自然聚落，致使湖泊湿地面积严重萎缩，到现在只剩下10 493 km²，50多年锐减了59. 4%，其中洞庭湖减少了47. 2%，鄱阳湖减少了41. 8%，江汉平原湖泊群面积则从8 330 km²下降到2 270 km²，不到新中国成立前的30%。湿地面积的大量减少，削弱了湿地的调蓄和缓冲功能，严重勘长了洪水泛滥。

此外，由于工农业建设和居民生活对湿地水源的截留和利用，也使湿地水资源急剧减少，导致湿地供水不足而退化、萎缩，这也是造成中国湿地面积减少的重要原因之一。

2.湿地污染日益加剧

环境污染是中国湿地生态系统面临的最严重的威胁之一。湿地污染主要由大量工业废水、生活污水的排放，油气开发等引起的漏油、溢油事故，以及农药、化肥引起的面源污染等原因所致。尤其在东部沿海、长江中下游湖区、东北油区及东部人口密集区的库塘湿地表现得最为明显。据中国科学院研究员李文朝测算，江苏太湖流域由于围垦湖泊、湿地而丧失的氮、磷去除能力，相当于太湖20世纪80年代末污染负荷量的37. 8%和93.9%。污染使湿地水质变坏、生态系统恶化，生物多样性受到破坏，越来越多的生物物种特别是珍稀生物将会随着污染的加剧失去生存空间而濒危或灭绝，种群的延续将因此受到极大的威胁。如云南滇池，由于多年排污的积累，江河湖库的内源污染迅速上升，首先影响水生浮游生物和鱼类，然后通过食物链影响食鱼鸟类的发育和繁殖，许多水禽由于严重的水污染而失去生命。

3.人为破坏湿地自然生态环境

湿地是许多动植物生长繁育的场所和遗传基因库，对维持生物种群有重要意义，其潜在价值难以估计。然而在开发利用湿地过程中，由于缺乏统一规划管理，导致湿地动、植物生存环境被人为改变，使湿地原有生态系统的稳定性和有序性被破坏。尤其是湿地上游水利工程建设，特别是大型水库的建设，不仅要淹没数以万计的农田，而且使江河天然生态系统被打破，导致某些生物丧失其生存场所，濒临灭绝。例如，长江三峡水库建成后，将形成600多千米长的水域，江水流速明显减小，部分泥沙淤积，鱼类的饵料生物组成发生较大变化，适应静水、缓流水生活的种类将成为水库内的优势种类，而原来栖息于该江段的一部分喜急流水生活的鱼类，会因为不能适应这种环境变化而逐渐减少以至消失。据估计，约有40多种鱼类将不适应在水库中生活。

4.关于湿地保护的法律法规严重缺乏

改革开放后，湿地资源的重要性日益突出，各地方人大、政府也都制定了具有针对性的湿地保护法规，到目前为止，共有如《黑龙江省湿地保护条例》、 《海南省珊瑚礁保护规定》等十几部保护湿地的地方法规。但从全国来讲，对湿地概念和全部生态系统类型的概念目前还没有法律条文上的明确定义，还缺少一部专门的湿地保护法来对这一珍贵的自然资源进行统一的法律保护。