蒜薹在贮藏前要进行挑选整理，剔除过细、过嫩、过老、带病和有机械伤的薹条，剪去薹条基部老化部分（约1厘米长），用塑料绳在距离薹苞3—5厘米处扎成0.5—1千克的小把，然后放入冷库菜架上进行预冷，最好在2—3天内将蒜薹温度降到0—5℃，预冷期间用液体保鲜剂喷洒薹梢，以防薹梢霉烂。当蒜薹温度降到0℃时装袋封口，进行贮藏。贮藏时蒜薹对湿度要求较高，若湿度过低，则易失水变糠。另外，蒜薹对低氧浓度和高二氧化碳浓度也有较强的忍耐力，短期条件下，可忍耐1%的氧气浓度和13%的二氧化碳浓度。对于长期贮藏的蒜薹来说，适宜的贮藏条件为：温度-1—0℃，相对湿度为90%—95%，氧气浓度为2%—4%，二氧化碳浓度为5%—7%。在上述条件下，蒜薹可贮藏8—9个月。