早期胚胎死亡可能与维生素A（没有形成循环系统）、维生素E（循环衰竭）、生物素、烟酸、泛酸、铜、硒和硫胺缺乏有关。过量硼或钼可提高早期死亡的比例。
中期胚胎死亡与维生素B12、核黄素、磷和锌缺乏有关。
中期到晚期胚胎死亡
与维生素B12、烟酸、维生素B6、泛酸和核黄素缺乏有关。
晚期胚胎死亡
与维生素B12、维生素D、维生素E、维生素K、泛酸、核黄素、叶酸、生物素、钙、锰、镁、磷、锌、碘和维生素B1缺乏有关。硒过量会增加晚期死亡比例。