选择健壮的母株，要求具有中等高度、茎秆粗壮、节间短、分株较集中等特点，母株选好后随拔随栽于留种田内。水芹留种田应选择温暖向阳、排水方便、便于去杂的水田。精细耕作，每亩施入腐熟的人畜肥1吨、草木灰50千克做基肥。在11月中旬或翌年3月底、4月初，选晴暖天气，从大田中拔选种株，以3-4根为1丛，理齐栽插。春栽成活后发棵较小，一般以冬前栽植较好。冬栽行距为30厘米，春栽行距为15厘米左右。种株在冬季栽植，要保持3-6厘米水层，封冻前加深水层，以叶尖露出水面为度，保温防冻。若是春栽，因气温回升，可保持3-6厘米浅水层。留种田一般不追肥，以防止植株柔嫩而引起腐烂。谷雨前后，株高30厘米时，清除过密分株、劣株、杂株、杂草，促进通风透光、植株健壮。