蘑菇菌种 
     
　　优良蘑菇菌种的菌丝为灰白色，密集，蓬松，呈细绒状，上下内外生长均匀一致，抗高温，抗病虫杂菌，吃料快，无扇形变异。匍匐型菌种的菌丝呈细绒状分布，无黄白色的菌被。 
     
　　培养料中的菌丝呈粗索状或细线状，呈淡黄色。菌丝干瘪萎缩，生长无力，或者上方出现很厚的黄白色菌被，均为老化菌种。 
     
　　出现绿、黄、黑或桔红色等染菌孢子的菌种必须淘汰烧掉。培养基上部菌丝干缩变质，下部菌丝生长良好，说明培养基太干，培养温度过高。若培养料中几乎见不到菌丝，内容物成糊状，说明温度过大，菌种过老，不能使用。 
     
    猴头菌种 
     
　　优良的猴头菌种，菌丝洁白、浓密、粗壮，上下内外生长均匀一致。在培养料上容易形成子实体。 
     
　　若菌丝干缩或瓶底有黄色黏液积存，为老化菌种，不能使用。菌丝生长缓慢无力、纤细，可能是培养料酸度不够或有机氮不足，应在培养料中增加麸皮或细米糠的用量，以改善菌种的营养条件。被杂菌污染的菌种不能使用。 
     
    平菇菌种 
     
　　优良的平菇菌种，菌丝洁白、粗壮、密集，菌丝生长均匀、整齐，呈粗羊毛状，爬壁性强。培养半个月左右，在瓶壁内可形成少量珊瑚状的小菇蕾或白色原基。 
     
　　多数品种在培养基上方表面形成绒毛状气生菌丝，低温品种气生菌丝常分泌黄褐色色素，特别是在高温季节，低温品种常出现红褐色或黄褐色的气生菌丝或黄水，这属正常现象。 
     
　　若培养基上方出现大量珊瑚状子实体或从瓶盖缝隙处长出子实体，说明菌龄过大，应尽快使用。若培养基干缩，瓶底积存黄水，为老化菌种不能使用。上部菌丝稀疏、灰暗、无力、干瘪，下部菌丝正常，说明初期培养温度过高，通气不良，或有细菌污染。如果出现黄、绿、桔红色，说明已被青霉、木霉和链孢霉污染，必须淘汰。菌丝在瓶中生长一半左右，不再向下生长，说明培养基过干、过湿、过紧，可用上部正常菌种，不再继续培养。 
     
　　金针菇菌种 
     
　　菌丝呈絮状，洁白、浓密、健壮、富有弹性。有时表面可见到粉状的粉孢子，为优良菌种。如有坚韧的菌膜出现，只要除去菌膜也可以使用。如果菌种干涸，菌柱收缩或菌丝自熔，产生大量红褐色液体，说明菌种生活能力弱；如出现黄色，则说明菌种老化。