1 ．种蛋的挑选
　　选择好的种蛋，不仅孵化率高，而且对雏鸭的质量和以后生长也有很大影响。因而在生产实践中，要对番鸭种蛋进行严格的选择，千万马虎不得。
　　（ l ）应选择生产性能高而稳定、繁殖力强、健康母番鸭所产的蛋。凡是患有白痢、慢性呼吸道疾病等传染性疾病的母鸭所产的蛋不能留做种蛋。
　　（ 2 ）蛋的大小应适中，符合品种要求。蛋重过重或过轻均不可用作种蛋。蛋形应正常，过圆或过长的蛋应剔除，否则影响孵化。蛋壳要完整，无裂缝；壳不能过薄、过厚，过薄、过厚均不利于孵化。
　　（ 3 ）种蛋应新鲜，蛋壳表面清洁，不能粘有粪便等污物。否则污染物中的病菌会侵入蛋内。
　　2 . 种蛋的保存
　　种蛋收集后要及时入孵。但在生产中不可能做到随收随孵，收集到一定数量后才能成批入孵，总有一个保存过程。种蛋即使经过严格挑选，品质优良，如果保存条件差，保存方法又不好，仍会对种蛋的孵化产生不良的影响。因此，应为种蛋保存创造一个良好的条件。
　　（ 1 ）保存时间：种蛋保存时间越短越好。保存时间短，孵化率高。保存时间7 天以内的，一般均能出雏。保存超过7 天，会使胚胎早期死亡增加，胚胎发育迟缓，孵化率降低，并且孵化出的雏鸭体质也差，成为弱雏，甚至成畸形雏。随着种蛋保存时间的延长，孵化率也不断降低。为保证种蛋有良好的质量，保存时间不宜过长，早春所产的蛋保存时间最长也不得超过14 天；夏秋季产的蛋应在7 天以内入孵。
　　( 2 ）温度：保存种蛋的温度以13 ～ 15 ℃ 为宜。保存时间7 天以内的，控制在15℃ ；如保持时间长的，温度可低些。但也不能过低，如低于10℃ ，就会影响孵化率，甚至因受冻而失去孵化能力；如温度高于胚胎发育的临界温度（23.9℃ ) ，胚胎会在保期间开始发育而不能出雏。
　　( 3 ）湿度：保存种蛋的相对湿度一般以70％ ～ 80％为宜。相对湿度过低，种蛋内的水分易蒸发，影响出雏率；如相对湿过高，有利于致病微生物的繁殖并侵入蛋内，使种蛋变质，导胚胎死亡。
　　( 4 ）保存环境：种蛋应贮存在专用贮存室内。先将种蛋码放在蛋盘里，然后放在蛋盘架上，层层放置。放蛋时最好蛋的小头向上、钝端朝下放置。贮存室应清洁，通风良好，空气新鲜，但又不能让冷风直吹，冬暖夏凉。贮存室内不能有蚊蝇、老鼠，也不能有异味。不能与农药、化肥等混放在一起。保存期间，在初期可不翻蛋。随保存时间延长，应每天翻蛋，以防止蛋黄与蛋壳膜粘连。
　　3 ．种蛋消毒
　　种蛋表面有许多细菌，如种蛋粘有鸭粪或其他污物，细菌更多，而且细菌的繁殖速度很快，如不及时消毒，沾污在种蛋上的细菌会侵入胚胎内。因此，种蛋在保存前和入孵前各进行一次消毒，以杀灭种蛋表面上的病菌。消毒方法很多，下面介绍常用的几种。
　　( 1 ）熏蒸法：这是当前使用比较普遍的一种消毒方法，既方便，消毒效果又好。用药量为每立方米空间用30 毫升甲醛、15 克高锰酸钾一起放在装有种蛋的容器里如瓷盘或碗，随即关闭门窗，室内温度保持在25 ～ 27℃ ，湿度75％ ～ 80 ％。熏蒸20 ～ 30分钟后打开门窗，以尽快排出药气，取出种蛋。消毒时应注意，甲醛和高锰酸钾作用后产生的气体，对人有刺激性，使用时应加以防护，避免接触到皮肤或吸入。
　　( 2 ）新洁尔灭消毒法：用5 ％新洁尔灭，加水配成0.1％溶液，对种蛋喷雾消毒。也可将种蛋放入40 ～ 50 ℃ 的0 . 1 ％新洁尔灭溶液，浸泡3～5 分钟后取出种蛋，待种蛋晾干后送贮蛋室或入孵。该方法使用也方便，但应注意，不可将肥皂、高锰酸钾、升汞、碘、碱等物质掺入，以免药液失效。
　　( 3 ）高锰酸钾消毒法：将高锰酸钾配制成0 . 02 ％溶液（即在50公斤水中加入10 克高锰酸钾），然后把种蛋浸泡在40℃ 溶液中2 分钟左右，取出滤干即可入孵。
　　( 4 ）紫外线消毒法：在离蛋面1 米左右处安装一40 瓦的紫外线灯管，照射10 ～ 15 分钟即可。
　　此外，还有抗生素溶液消毒法、氯消毒法、洗涤消毒法等，用得较多的是前面3 种方法。饲养者可根据具体情况选用。在消毒过程中，应注意的是，种蛋从消毒室内取出放入贮蛋室，如两个地方温差较大，种蛋应逐步降温。否则因温差较大，蛋壳表面会凝集湿气，使蛋壳表面外膜的保护作用受到破坏，细菌容易入侵。