目前大多数农药为有机化合物和无机化合物，其物理性能和化学性能因药而异，比较复杂。在保存期间都有特殊的要求，应严格按使用保管要求管理，如保存条件不适宜，农药就会变质，失去药效，有时还会发生燃烧式爆炸事故，或造成人畜中毒事件等。因此，各种农药必须要专门妥善保管，在保管过程中，必须注意以下几点：
    1、注意存放地点。存放农药的房屋，必须做到离粮仓、饲料房、牲畜棚圈尽可能远一些，防止污染和相互影响，也不宜与化肥同放，因为化肥和农药的种类都很多，性质各异，存放一起会发生化学反应，导致质变或失效。如碳酸氢铵当气温达到摄氏30度时会分解，释放出氨气，氨气在潮湿的条件下化合成碱性较强的氢氧化铵，可使遇碱分解的农药降低药效。同时各种性质（即通常农药分碱性、中性和酸性）不同的农药要分开存放。
    2、注意存放温度。存放农药的温度不能过高过低，一般在摄氏30度以上的温度条件下，温度越高，农药越容易融化、分解、挥发，甚至燃烧爆炸；温度太低对农药也有不利的影响，如有些液体农药，在摄氏0度以下就会结冰，使农药的药效降低。因此，保存农药，夏天要防止高温，冬天要防止低温。
    3、注意存放湿度。有些农药，如可湿性粉剂等，容易吸潮，吸湿后变成硬块，一来使用的时候比较费事，二来会变质失效，纸包装的农药受潮后容易破裂，不仅不好搬运，还会污染周围环境。
    4、注意长时间暴露。农药长时间暴露在空中和阳光下，容易挥发和发生氧化作用等，引起质变。如辛硫磷见光易分解、变质。一般固体农药要包装严密，液体农药要用有色瓶子或罐子盛装。总之不管是固体还是液体农药，都不能直接在阳光下曝晒，要把农药放在阴凉、干燥处密闭保存。
    5、注意远离火源。药库或药箱要远离火源，尤其是瓶装农药要严密封口，防止毒气挥发、燃烧，以免引起人畜中毒。