农药合理混用能加强药效，但是，农药混用不当会使农药降低药效，增加成本，有的还会出现药害。现将不能混用的农药介绍如下：
　　 
　　混合后发生化学反应致使作物出现药害的农药不能混用。波尔多液与石流合剂分别使用，能防治多种病害，但它们混合后很快就发生化学变化，生成黑褐色硫化铜沉淀，这不仅破坏了两种药剂原有的杀菌能力，而且生成的硫化铜会进一步产生铜离子，使植物发生落叶、落果、叶片和果实出现灼伤病斑，或干缩等严重药害现象。因此，这两种农药混用会产生相反的效果。喷过波尔多液的作物一般隔30天左右才能喷石流合剂，否则会产生药害，石流合剂与松脂合剂、有机汞类农药、肥皂或重金属农药等也不能混用。
　　 
　　酸碱性农药不能混用。常用农药一般分为酸性、碱性和中性三类。氟铅酸钠、砷酸铅等是中性农药。硫酸铜、氟硅酸钠、白砒、过磷酸钙等属酸性农药，松脂合剂、石流合剂、波尔多液、砷酸铝、肥皂、石灰、石灰氮等属碱性农药、酸碱性农药混合在一起，就会分解破坏，降低药效、甚至造成药害，大多数有机磷杀虫剂如乐查、杀螟松，马拉硫磷，磷铵等和部分微生物农药如春雷霉素、井岗霉素、灭瘟素等以及猪稻净、代森锌、代森铵等，不能同碱性农药混用，就是农作物撒施石灰或草木灰，也不能喷洒上述农药。
　　 
　　混合属乳剂被破坏的农药不能混用。含钙的农药如砷酸钙、石流合剂、甲基砷酸钙等。一般不能同乳剂农药混用，也不能加入肥皂，因为肥皂、乳油容易同含钙的药剂发生化学作用，产生钙皂沉淀，乳剂被破坏，药效降低，还会发生药害。
　　 
　　杀菌剂农药不能与微生物农药混用。杀菌剂对微生物有直接杀伤作用，若混用微生物即被杀死，微生物农药因而失效。