2006年，江苏省常州市武进区水稻机械插播、机械收获面积双双超过90％，远远高于全国平均水平，从而成为全国水稻生产全程机械化第一县（区）。山东省桓台县则以玉米机收水平超过80％的业绩，成为中国玉米收获机械化第一县。标志着我国农业机械化在最艰难的攻坚战中取得了突破性进展。水稻和玉米生产机械化第一县的出现，起到了良好的示范带动作用。经过十年发展，截至目前，作为薄弱发展环节的水稻机插率全国已达38%，玉米机收率达55%。

2006年5月，农业部和国家安全生产监督管理总局联合发出通知，从2006年起到2008年在全国组织开展“创建平安农机促进新农村建设”活动。全国各省（区、市）结合各地情况，将分别建设十个“平安农机”示范县、百个“平安农机”示范乡（镇）、千个“平安农机”示范村和万个“平安农机”示范户。此后，“平安农机”示范县、示范窗口、岗位标兵创建活动持续深入开展，为强化农机安全监理，保证农机安全生产起到了重要作用。

2007年6月10日，由中国农业机械化科学研究院牵头组建的农业装备产业技术创新战略联盟在北京正式成立。这是我国首批成立的四个行业技术创新联盟之一。中国农业机械化科学研究院牵头联合了中国一拖集团、山东时风集团等8家农机行业骨干企业，中国农业大学、浙江大学等4所高校以及黑龙江农机院等3家科研院所共15家单位为发起人共同组建“联盟”，涵盖了农业装备主要技术与关键产品领域。联盟以企业为主体共同筹集3000万元资金，建立行业关键共性技术研发资金。“联盟”是“十一五”期间我国科技体制改革的一种尝试和积极探索，构建了科研、设计、工程、生产和市场紧密衔接的完整技术创新链条，对于全面提升农业装备制造业水平、促进农业装备国产化，装备中国农业、提高国际竞争力将起到重大作用。

2007年，我国主要农作物耕种收综合机械化水平达到42.5%。根据国家农业机械化发展水平评价指标体系中有关发展阶段的划分标准，我国农业机械化的发展水平，已经由初级阶段跨入了中级阶段，标志着我国农机化事业发展进入了一个新的历史阶段。我国农业已进入增机减人（转人、育人）发展现代农业的新时代。

2007年9月24日，农业部、公安部、发改委、交通部、中石油、中石化6个部门联合印发《关于做好农机跨区机收工作的意见》。这是时隔10年后，全国跨区机收工作领导小组成员单位再次联合印发文件，进一步明确了农机跨区作业发展的管理服务措施，推动农机跨区作业由夏季向春秋两季扩展，由小麦向水稻、玉米等作物延伸，由机收向机耕、机插、机播等领域拓展。此后，农机跨区作业规模不断扩大、领域不断扩展，有效解决了我国一家一户的农业经营模式与大规模农机作业之间的矛盾，形成了具有中国特色的农业机械化发展道路。

2008年中央一号文件强调突出抓好农业基础设施建设，要求加快推进农业机械化。文件指出，推进农业机械化是转变农业生产方式的迫切需要，也为振兴农机工业提供了重要机遇。

十七届三中全会通过的《中共中央关于推进农村改革发展若干重大问题的决定》中也明确提出“支持农用工业发展，加快推进农业机械化。不断促进农业技术集成化、劳动过程机械化、生产经营信息化。适应农业规模化、精准化、设施化等要求，加快开发多功能、智能化、经济型农业装备设施，重点在田间作业、设施栽培、健康养殖、精深加工、储运保鲜等环节取得新进展。”