有机肥需经过发酵处理。许多有机肥料带有病菌、虫卵和杂草种子，有些有机肥料中有不利于作物生长的有机化合物，所以均应经过堆沤发酵、加工处理后才能施用，生粪不能下地。　　

（有机肥的使用禁忌。腐熟的有机肥不宜与碱性肥料和硝态氮肥混用。）　

　　有机肥无论基施和冲施，最好配合生物肥施用。生物肥中的生物菌能加速有机肥中有机质的分解，使其更有利于作物吸收，同时能将有机肥中的一些有害物质分解转化，避免其对作物造成伤害。一般在基施有机肥时，可每亩配合施用生物肥150-200kg，作追施时，每亩可施入20-25kg。

　　肉眼鉴别。生物有机肥在有益微生物作用下，发酵腐熟充分，外观呈褐色或黑褐色，色泽比较单一；而其他有机肥因生产操作不同，产品颜色各异，如精制有机肥为粪便原色，农家肥露天堆制，颜色变化较大。