税费改革后，由于村级收入受到较大的影响，政府随即启动了合村并组的工作，意即通过减少村干部人数来减少支出，保持村级组织的正常运转。实际上，随着国家之后几年加大对农村的投入，村干部的工资都有了保障，而且一年一年大幅度地提高，村干部支出这一块并没有减少，而只是提高了村干部人均工资水平。

　　村干部的人均工资水平提高了，村干部的工作积极性有所提高，特别是对于那些不能出去或者不想出去工作的村干部，较好的工资水平对他们来说还是很有吸引力的。但是，随着近些年村干部逐渐为富人所代替，当前村干部的的工资水平相对于他们的收入而言就太少，其吸引力也就显着下降。从这个角度上看，当年合村并组的正面潜力已经发挥殆尽。

　　然而，合村并组之于乡村治理的诸多困扰却遗留下来。我们所调查的S镇，在2003年以前是19个行政村，而在合村之后减少至12个村。合并村庄后，每个村的村干部都减少，尤其是那种人口相对较少的被合并村庄，他们的村干部名额就更少。如此，村干部名额的突然急剧减少成为村庄政治的一个矛盾。

　　如新北庙村，它是由原来的北庙村与南庙村合并而成，前者有人口2000多人，后者有1000多人，当时政府规定只给5个干部名额，北庙3个南庙2个，但是后来北庙村的干部认为自己人多要增加1个名额，多次向上反映后镇政府被迫同意。类似的还有如新赫村，它由原来的3个村子合并而成，政府开始也是只给5个干部名额，由于原来3个村子人口差不多，5个名额势必有个村子只有1个干部，村干部为此向镇政府反映增加到6个名额。

　　这两个村子的问题还是比较平和的，镇政府处理得也较为灵活，但是也有矛盾很大的村子问题至今没有解决。S镇的玄村人口800左右，在全镇是属于小村，2003年底政府将其与其他两个村子合并到双村，由于双村人口较其他三个村子多，合村后就是双村出两个干部，其余村子各出一个干部，玄村的老干部感到很不满，再加上玄村与双村村民历史上就不太合，就发动村民要求独立，甚至为此上访到省里，后来看到独立无望，就要求与比自身人口更少的獐村合并，这个要求还是没有得到允许，于是转而要求与稍远点的岔村合并，此事拖延日久，镇里实在是没有办法只有答应了。现在，玄村大小事务属岔村，不过在行政规划上还是在双村。

　　从以上几个案例中，我们发现，村干部的数额的减少引发了村庄政治精英的不满，从村干部个人来讲，他们应该都是基于个人利益的考虑，不过从村庄的权力结构来看就不是如此简单，正是合村导致村干部名额的减少打破了原有权力结构的平衡。这个平衡在集体化时期逐渐形成，当时村里大小干部很多，数量多就能够照顾到村庄的方方面面的群体与派系，从这个角度来讲，那个时候恰好是一个村民高度参与的民主时代。这种平衡延续到了90年代，到了90年代中后期，国家在减轻农民负担及精简国家机构的背景下，村干部的名额逐渐减少，比如S镇每个村在1998年后就减少到4个正式村干部，这种平衡逐渐被打破，到了2003年的大规模合村运动后，有的村子减少至只有1个村干部，这种平衡就被彻底打破了。当然，镇政府针对基层的这种“抗争”也相应做了些调整与变通，大部分的矛盾消化在内部。

　　合村后村干部的名额分配是按照人口多少来确定的，这就有点类似所谓的“选区制”，这种选举模式的好处基层干部看得很清楚，S镇人大主席认为，“名义上是合并着一块选，实际操作的过程中划分成几个选区，每个选区给几个指数，这样就保证人少的村子都有干部”。“选区制”其实在村民自治的初期就有人提出来，不过却是在合村以后才实行，这种效果就大打折扣了。同时，合村后还有个问题就是小村很难出正职干部，“原来两个村还有各的干部，小村也有书记主任，现在小村很难有自己的书记和主任，大部分是大村占据，因为是先分配指数，再集中在一起选举书记和主任”。小村只能出副职干部，村干部之间就容易闹矛盾，就增加了合村后村庄治理的难度。

　　在合村后村级组织实际运作中，大多实行的是“一国两制”。“一国”一般只在正式的行政规划上及选举时期体现出来，而“两制”则在多个核心方面体现出来。首先是村务，玄村村长姜军就说，“咱们是合并村，实际上是小独立，他们有什么事咱们也不参与，我们有什么事就也不参与”。其次是财务，当地有“一村两账”甚至“一村三本账”的说法，即老村各自有自己的账目，还有为了应付政府要求做的统一账目。其三是集体财产上，当地的最大一块集体财产就是林子，合村后林子还是属于原来老村集体所有，新村村级组织和村民并不能从中分享。从这几个核心层面看，新村无法做到有效的整合，合村基本上是表面的，只是应付上级政府的改革要求。