除以上三种渠道外，必要的时候政府还可以通过财政注资的方式，对农村的金融机构提供资本金支持。据银监会的有关调查统计，由于历史和现实的诸多因素，我国农村金融机构的资产质量普遍不高。2007年末，按照五级分类，农业银行不良贷款率为26.3%，农业发展银行不良贷款率为54.1%，而同期工、中、建、交行都已经达到了5%以下。截至2006年中期，农村信用社按照四级分类统计不良贷款率为16.9%，如果按照5级分类，可能要达到30%，整体比城市金融机构高20%。由此可见，农村金融机构的资产质量令人担忧。农业银行、农业发展银行、农信社等金融机构在支持“三农”上发挥了重要的作用，以前的一些亏损尽管有自身经营不善的原因，但更主要的是政策性的因素，因此在必要的时候，财政一定要出面，充实金融机构资本金，消除其部分不良贷款。当然这并不意味着财政完全兜底。在注资的同时，政府应要求金融机构加强信贷和风险管理，做到有奖有罚。