新型农村合作医疗工作启动实施以来，民勤县积极探索建立健康管理“防生病”、门诊补偿“治小病”、住院补偿“治大病”的农民健康保障新模式。至2011年底，累计有117.95万人次享受到合补偿资金1.24亿元，实际补偿比由2005年的27%提高到了62%，住院费用平均自付比例由73%下降到38%。

2012年全县参合农民20.95万人，参合率达96.06%，比2005年提高了15.84个百分点，农民人均筹资水平由2005年的30元/年提高到2012年的290元/年，筹资基金达6078.69万元，累计筹集资金达1.44亿元。