一、孵化前的准备
为了避免在孵化期中发生故障。因此，在孵化前全面进行检修工作，检查温度调节器、温度计的准确性；电动机、风扇、电热器、指示灯以及报警装置等是否灵敏，孵化机的门、四壁及地板是否严密，蛋盘和出雏盘是否牢固等进行检查。准备好发电机，以备停电时使用。
孵化机进行消毒、试机24小时一切正常，才可入孵种蛋，来自贮蛋库的种蛋，置于22摄氏度左右的孵化室内预温46小时，鸡蛋大头朝上装盘入孵和消毒。
二、
孵化机的管理
现代立体孵化机的机械化、自动化的程度较高，因此，管理相对比较简化，但是入孵量大，一旦发生事故，将造成很大的经济损失，管理人员必须认真做好下列几项管理工作：
1.温度的调节
注意温度的变化，观察调节器的灵敏度，以及温度表指示灯的变换是否协调一致。如温度调节性能稳定，一经调温后不要轻易扭动，除非偏离温度0.5摄氏度时要即时调节。一般每小时记录一次温度。
2.湿度的调节
现代立体孵化机具有自动调湿设备，无自动调湿的孵化机，其内设有水盘，每天要定时往水盘加水，如湿度过大，减少水盘，湿度不足增加水盘或调节水温。湿球计水杯应经常注满水，定期清洗和更换棉绳，以确保湿球计的准确性。
3.通气、翻蛋及其他管理
孵化机的风扇、蛋架要保持清洁无灰尘，以免影响孵化机内的通风。立体孵化机能定时按固定角度翻蛋，一般每13小时翻蛋1次。用手摇动翻蛋操作时要轻、稳、慢以免出故障。电动机应定期加油，注意机件的运转是否正常，有无异常的声音。每天要认真做好温湿度和室温等记录工作。
4.照蛋
定期进行照蛋，检查胚胎发育情况，照蛋操作要求轻、快、准动作要小心稳当，防止碰震、破损胚蛋。观察要认真以免漏照和错照。
5.移蛋（落盘）
将胚蛋从孵化盘移至出雏盘通称移蛋、移盘（落盘）。鸡胚于孵化第1819日龄移至出雏盘。移蛋的日龄视胚蛋发育情况而定，如胚胎发育迟缓可延迟1224小时移蛋。胚蛋移入出雏盘时，要平放并停止翻蛋。
6.出雏
鸡胚20天开始出雏，将出雏机的照明灯关闭，以免雏鸡骚动而影响出雏。当开始出雏后34小时，待雏鸡羽毛已干就可以拣雏，同时拣出空蛋壳。
7.清理
孵化结束后，撤出孵化盘、出雏盘、水盘、刷去碎蛋壳、污物和绒毛并冲洗干净、晾干，然后熏蒸消毒或使用消毒液消毒均可，以供备用。