鸡种蛋的整个孵化期中，鸡胚胎的死亡有两个高峰期:一是在孵化前期，即入孵第4-5天；二是孵化后期，即入孵第18-20天。尤其在后期死亡率更高。第一个死亡高峰期正是胚胎生长迅速、形态变化显著的时期，胚胎对外界环境的变化很敏感，稍有不适则易造成胚胎的死亡。第二个时期胚胎正转入肺呼吸时期，生理变化剧烈，需氧量增加，胚胎温度增高，若通风换气不良，散热不好，则易造成胚胎死亡。如死亡比例较大，则应分析原因，及时解决。
影响胚胎发育有内部和外部原因，包括种蛋的内部品质、种蛋保存和孵化条件。前期死亡过高主要是种蛋品质不良，它又决定于种鸡的营养水平和健康状况。如种鸡饲粮缺乏维生素A、维生素B2，种鸡患病等；种蛋保存时间过长，保存条件不当；孵化温度过高，翻蛋不够等。中期死亡除了种鸡饲粮不完善、种蛋管理不良外，主要由于孵化条件不当所致。如孵化温度过高、通风不良等；翻蛋不当，造成胚胎粘连，胎膜发育不良。后期死亡过高同样是由内部和外部因素造成，孵化条件特别是孵化温度高影响更为严重，而孵化温度低则造成胚胎极度衰弱，通风不良则易造成胚胎的窒息。出雏时高温高湿且通风不良，易使胚胎呈畸形，生活力降低，啄壳无力，导致死亡。通过照蛋、转盘、出雏和清理死胎等各个环节的工作检查，分析胚胎死亡的原因。