断喙前，首先把断喙器摆正并接通电源，然后根据个人习惯调整座位高度，待断喙器刀片呈明亮的橙黄色时，即可以开始操作断喙。
断喙时，操作手法要稳、准、快。用大拇指轻按在鸡颈后，食指放在颈下将其握住，向下、向后施加压力，使鸡嘴闭合，舌头后缩。将雏鸡头部略向下倾斜，喙尖抵在刀片上，随着鸡喙被灼烧，断喙者会感觉到向前推动鸡头需要更大的力量。认真感觉将鸡啄灼烧到要求长度时所需要的力度，然后将整栋的鸡准确断喙。
对母鸡的断喙应上喙断掉1/2，下喙断掉1/3，由于断喙时的灼烧会造成一截死喙，实际上应把上喙断掉1/3，下喙断掉1/4。随着雏鸡的成长，死喙逐渐脱落，便达到了断喙目标。公鸡断喙要轻于母鸡，因为喙太短会影响受精率。
由于断喙时食指向后拉喙，下喙的位置会向后错动。如果断喙时雏鸡的喙中线与刀片垂直，下喙会灼烧不够，把断了喙的雏鸡松开就会发现下喙过长。为了使雏鸡断喙后上下喙能整齐紧密闭合，首先使鸡喙垂直接刀片并将上喙断到合适长度，然后在鸡喙不离开刀片的情况下，手略向下移动使下喙单独接触刀片，将下喙断到合适长度。也可以准确把握好喙与刀片的接触角度，一次性断好上下喙。前者的缺点是灼烧时间过长，造成的应激较大；后者的缺点是很难准确把握角度，容易造成上下喙不能整齐闭合或雏鸡之间喙长不整齐。
断喙过程中操作不当往往会造成以下几种后果：一是断喙过轻，没有起到避免啄伤的效果。二是断喙过重，影响采食和受精。三是断喙时鸡嘴张开，导致烫伤舌头。四是下喙端不整齐，上下喙无法严密闭合，影响采食。五是灼烧时喙向两侧偏，导致歪嘴。六是鸡喙在刀片上滑动，导致歪嘴。七是断喙时手指错动使上下喙错开，造成交叉嘴，影响采食。
在断喙器使用一段时间以后，刀片上可能会粘有一些烧焦的组织，此时应该用特定的工具进行清理，使刀片保持所需的温度。
断喙完成后，应检查鸡群中是否有个别鸡发生出血现象。如有个别出血的鸡应挑出，并进行第二次轻度灼烧止血。
断喙尽可能一次成功，轻易不要在鸡长大后修喙，以免引起感染。