种鸡场采用的饲养工艺和设备不同，种鸡的饲养方式也会迥然不同，种鸡的配种方式也就因环境而异。总的来说，种鸡的配种方式不外乎两种：自然交配和人工授精。
自然交配的配种方式，主要适用于平面饲养条件下的种鸡。平面饲养可以是地上饲养、网上或板条网板上饲养，这些都是大群种鸡的饲养方式，少者几十只几百只，多则几千只，一般以1000只左右一群为宜。
自然交配情况下，要注意公母鸡的适当比例备留一些公鸡，当出现公鸡伤亡时作必要的补充，否则会影响受精率，一定要选留腿脚健壮的公鸡。平养种鸡感染疾病的机会较多，特别是沙门氏杆菌病的净化工作比较困难，平养方式一般都采用网上平养，这样鸡不与粪便接触，染病的机会就会大大减少，平养的种鸡由于鸡群较大，发生啄肛的现象较多，特别是开产初期，因此需要责任心很强的人员来管理鸡群。
种鸡按规定的公母配比进行饲养管理，任公母鸡彼此间自由交配，收集种蛋。平养鸡的种鸡要设置产蛋箱，并且必须及时拾鸡蛋，否则容易把蛋弄脏和造成破损。平养的种蛋一般较脏，蛋壳的污染程度较高，特别是地面平养的鸡，因为鸡爪直接接触地面的泥土和粪便。平养的最大好处是收留种蛋方便，只要公母比例适当，种蛋受精率就有保证。但要格外加强清洁卫生工作，如打扫粪便，勤换鸡窝的垫料等。
一般种鸡场都采用笼养方式饲养种鸡。笼养种鸡可以充分利用鸡舍面积，增加饲养容量，卫生条件好，管理方便，种蛋比较清洁，蛋壳受污染的机会少，种蛋破损也较低。例如：用小群种鸡笼(俗称配种笼)饲养，一般养24只母鸡和2～3只公鸡，公母混养，自由交配。无需设置产蛋窝，母鸡产蛋直接滚到网底的集蛋槽上，定期收集种蛋，这比平养自由交配的种鸡要优越得多。当然，笼养种鸡的一些缺点如蛋的破损率、鸡的伤亡率较高等仍然存在。
种鸡笼养实行人工授精，是当今最先进的繁殖方法。这种配种方式可以大大减少种公鸡的饲养量，充分利用种用价值高的优秀公鸡，大大降低公鸡的饲养成本，能够更充分地利用鸡舍面积，公母鸡的死亡率都较低，公母比例可从平养时的1：10～15扩大到1：35～40，并且可以按照供种需要随时提供受精率高的种蛋。
人工授精技术经过1周的培训就能基本掌握，与平养种鸡相比，需要将附加的劳动力，组织一个专门的人工授精小组。而且要严格执行人工授精的技术，每5～7天输精一次，否则种蛋的受精率就会受影响，这是一项认真而又细致的工作。鸡的人工授精技术在国内外的普及，已证实其先进性和明显的优越性。