新挖回的荸荠，先在室内干净的砖地上摊晾10天左右，并除净泥土杂物，剔除病烂果。

荸荠数量不多，可用缸藏法贮存。将缸用硫磺粉每立方米10克~15克或2%福尔马林溶液熏蒸24小时消毒，放入摊晾好的荸荠，盖严缸盖即可。

荸荠数量较多，宜用室藏法贮存。先把房屋打扫干净，用硫磺粉或福尔马林（用量和方法同上）消毒，在室内用砖砌池或用长方形的贮藏柜（大小视荸荠数量而定，最高不超过132厘米），池（柜）底铺一层塑料薄膜防热、防潮，再铺一层13.2厘米厚的荸荠，再铺一层6.6厘米厚的细沙，如此一层荸荠一层细沙的铺放，至100厘米~117厘米高为止，最后在上面盖13.2厘米的细沙。，贮藏期间要定期检查，发现霉烂或生虫的应及时处理。

如遇阴雨天气，要将贮藏室门、窗打开，或定期揭开贮藏缸缸盖，通风排湿，若气温较高，则不可揭开缸盖。