波尔山羊病防治必须贯彻“预防为主，防重于治”的方针，以保证羊只健康地生长发育。特别是随着集约化养羊业的发展，种羊场、养羊户越来越多，规模不断扩大，坚持“预防为主”的原则尤为重要。下面首先介绍波尔山羊病的一般预防措施，随后按寄生虫病、传染病、胃肠疾病、产科疾病及其它五大类山羊最常见的疾病逐个阐述。
1.科学饲养管理波尔羊适应性强，耐粗饲。在春、夏、秋之季，均以饲喂野草为主，冬季可喂于树叶、山芋藤、花生秧、豆秸、菜籽壳等，辅以少量精料。也可饲喂经微贮、氨化的稻秸、麦秸、玉米秸或青贮饲料。但应注意以下几点。
①饲草、饲料必须清洁，不能霉变，饲草不带水，不带泥，晾干后再给羊吃。
②饮水要清洁，冬天给温水，水中要放少许食盐。
③经常保持羊舍清洁，干燥通风，做到冬暖夏凉。
④适当增加羊只运动，保持羊体卫生。
⑤要把种公羊、母羊、怀孕母羊、带羔母羊、断奶羔羊、育成羊分圈饲养，编好耳号，建立卡片档案。
2.圈台定期消毒波尔山羊的圈舍定期消毒，可将草木灰、生石灰粉撤在圈舍内，也可用如下药品消毒圈舍和用具。
①3%来苏尔溶液；用于圈舍、用具、洗手等消毒。
②10%～15%生石灰溶液：用于圈舍、排泄物消毒。
③0.5%过氧乙酸溶液：用于喷洒地面、墙壁、食槽等。
④1%～2%氢氧化钠溶液：用于被病菌、病毒污染的圈舍、地方和用具的消毒。因本品具有较强的腐蚀性，消毒圈舍时应驱出羊只，隔半天后用净水冲洗饲槽、地面后方可让羊进圈。
⑤氯胺：0.5%～2%氯胺溶液用于污染的器具和圈舍消毒，0.05%氯胺溶液用于饮水消毒。
⑥抗毒威：1：400稀释液喷洒，进行圈舍消毒。灭蚊蝇的药液有敌敌畏、灭蚊灵、灭蝇灵等，但要注意波尔山羊只的安全。
3.定期驱虫每年于春、秋两季进行定期驱虫。可根据当地常发的内外寄生虫种类，有目的地选择有效药物进行驱虫，并做好粪便中虫卵的无害化处理。
4.计划免疫所谓计划免疫就是针对当地曾发生过的某种(些)传染病及其流行季节，有计划地进行免疫预防接种。包括口蹄疫、结核病、布氏病、梭菌等病的免疫接种。