奶牛发生流产大多数为普遍性流产。普遍性流产的主要原因有以下几方面。
　　营养性流产 许多农户对奶牛实行粗放式饲养，特别是在奶牛干奶期实行粗放式饲养，结果造成母牛瘦弱，胎儿得不到足够的营养，为此造成怀孕母牛流产；因饲料单一，饲料中缺乏维生素A、E、D、矿物质（微量元素）等，造成胎儿难以发育及母畜生殖器官的病变与激素分泌上的紊乱而引起流产。
　　机械性流产 因对奶牛管理粗放，奶牛经常互相顶撞，人为粗暴式驱赶，粗暴式的直肠检查，运动场及牛舍太滑等因素造成母牛流产。
　　给奶牛喂发霉变质的草料 如发生霉变的玉米含有赤霉烯酮易使母牛流产；在奶牛妊娠后期给奶牛喂发霉的酒糟易造成妊娠母牛流产或生下弱犊牛或失明的犊牛；给奶牛喂葵花子饼超量，易使妊娠中断，排出死胎；给奶牛喂冰冻饲料，易引起子宫平滑肌收缩，造成孕牛流产。
　　应激反应造成流产 奶牛长途运输；牛舍环境过度潮湿、拥挤、闷热，气温在30℃以上，牛易发生中暑，在强烈的日光照射下牛易患热射病引起流产。
　　疾病性流产 奶牛的心、肺、肝、肾及肠道疾病，严重的大出血、下痢和鼓气等都易造成怀孕牛流产。
　　药物流产 服用腹泻药、皮质激素药、麻醉药、驱虫药、利尿药、发汗药等都易使孕母牛流产。
　　自发性流产 孕母牛胎盘异常，绒毛膜发育不全，绒毛变性，使胎儿得不到足够的营养，造成妊娠中断；孕母牛胎膜水肿和羊水过多，由于胎膜部分扭转或母体血液循环紊乱而造成胎儿不能正常发育引起流产；胚胎早期死亡，由于精卵不健康，黄体酮不足，母体疾病和有害因素影响，饲料中蛋白质不足或过剩，免疫力不相符合等都容易造成怀孕母牛发生流产。
　　激素紊乱性流产 孕酮与一定比例的雌激素共同作用使胚胎发育、雌激素过量或孕激素减少均易造成流产。
　　其他因素造成流产 母牛患传染性疾病流产：如布氏杆菌病、钩端螺旋体病、弧菌病、病毒性腹泻、传染性气管炎；霉菌性流产：如衣原体病、李氏杆菌病、流行性热等;寄生虫性流产：如滴虫病、肉孢子虫病、新孢子虫病等。