大量而广泛的使用抗生素，病原微生物直接或交叉产生耐药性。即在病原菌广泛接触抗生素后，引起染色体突变，垂直地传给子代，使子代产生耐药性。这种耐药性有速发而持久的链霉素型和缓发、阶梯式不稳定的青霉素型两种。也可因病原菌在抗生素的作用下，细胞质中产生耐药的R-因子，垂直或水平的转移给敏感菌，使之获得耐药性。耐药菌通过纤毛与敏感菌接触，形成特殊的渠道将R-因子输入给敏感菌，使病原菌获得耐药性。病原菌获得耐药性以后，迅速降低对抗生素的敏感性。给临床治疗造成困难。

　　在饲料中长期添加促生长抗生素或药物抗生素，在杀灭肠胃道致病微生物的同时，与动物生存有密切关系的有益微生物也被杀死，破坏了正常的生物区系，致使猪只消化机能下降，消化能力减弱，体质变差，免疫机能降低，易感疾病，治疗效果差，死亡率高。

　　由于猪只病多体弱，病原微生物的耐药性增强，医疗效果不佳，猪病越来越多。在此情况下，养猪生产者需要添加更多的抗生素，以预防疾病发生。如此形成恶性循环，猪病越来越多，药越用越多，猪只体质越来越差，猪病无法控制。