母畜怀孕后各器官系统发生一定的生理变化，对药物的反应与未孕母畜不完全相同，药物的分布和代谢也受妊娠的影响。因此，孕畜临床不合理用药将导致胚胎死亡、流产、死胎和胎儿畸形。通过几年的实践经验，总结孕畜合理用药的原则以供同行借鉴：
　　１、孕畜发生疾病治疗时，首先考虑药物对胎儿和胚胎有无直接或间接的严重危害作用。其次是药物对母体有无副作用与毒害作用。
　　２、怀孕早期用药要慎重，当发生疾病必须用药时，可选用没有引起胚胎死亡和致畸作用的常用药物。
　　３、孕畜用药剂量不宜过大，时间不宜过长；以免药物蓄积作用而危害胚胎或胎儿。
　　４、孕畜应慎用全身麻醉药、止泻药、驱虫剂和利尿剂，禁用有直接或间接影响生殖机能的药物，如前列腺素、肾上腺素和促肾上腺皮质激素、雌激素。严禁使用子宫收缩的药物如催产素、垂体后叶制剂、麦角制剂、氨甲酰胆碱和毛果芸香碱。使用中药时应禁用活血祛瘀、行气破滞、辛热、滑利中药如桃仁、红花、乌头等。云南白药、地塞米松也应慎重使用。
　　５、孕畜发生疾病时，须考虑药物对胚胎和胎儿有无潜在性危害作用，但要改变那种认为“孕畜用药都是有害的”的观点，为了胚胎和胎儿的安全而延误孕畜的治疗，反而损害母畜的健康，造成母畜与胎儿双亡的现象。因此，孕畜患病时应积极用药治疗，确保母体健康，力求所用药物对胚胎儿无严重危害作用。