尽管彻底扑杀禽流感鸡群是无HPAI国家控制该病的手段。深入的监测表明数目浩大的野鸟是该病病毒的携带者，而且病毒也可以从外来的禽种及宠物鸟类引入，所以需要重新评估扑杀鸡群是否为控制禽流感的唯一途径。同时在墨西哥Yucatan及其它与美国南部接壤的州中H5N2抗体存在于鸡群中，又使人们必须重新评估免疫是否是控制禽流感的一种有效措施。美国农业部已经许可于明尼苏达州及其比邻的州中在火鸡群中使用禽流感灭活疫苗（H5和H7除外）来控制由低致病病毒引起的呼吸道感染。也许可生产和储备H5灭活苗以便用于从墨西哥扩散的发病案例。但美国农业部尚未允许在宾夕法尼亚州使用灭活苗来抑制商品蛋鸡群中间感染的低致病性的H7N2病毒的传播。在美国，越来越多的人们认为免疫接种可与隔离检疫、进一步完善的生物安全措施以及扑杀感染鸡群等措施相结合，采用多元化的程序控制HPAI。
　对禽流感的控制将结合早期诊断、利用先进的分子生物学技术对病毒进行分离鉴定、隔离检疫、有选择性的淘汰及对鸡群进行免疫接种等措施。在将来制定控制禽流感的政策时，经济学模拟也将扮演重要角色，并由此更为合理地安排生物安全、免疫及扑杀方案，以确保最大限度地减少家禽生产者和消费者的经济损失。