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一、螨虫
在饲养土元中因喂食过多，经常积剩，或者饲养池内饲养土湿度过湿，导致螨虫的产生，或是土元饲料中如麦麸、豆粉、玉米粉存放时间过长，本身已有大量螨虫带到饲养室喂食，螨虫的繁殖很快，发现后应立即采取以下措施：
1、刮除表面一层土，特别是食台周围的表层土用窗纱筛把土筛出丢掉，如筛子有一点土元可用5%的漂白粉水拌一下土元虫体再放入饲养池内。
2、降低饲养池内土的温度，达到稍干一点。
3、减少或不喂食物。
4、增加土元的密度，来达到以多取胜的原则除去螨虫。
5、把有螨虫的饲料高温杀灭。
6、用麦麸拌水捏成团，在养殖池内每平方放三到五个，二小时后把麦麸团丢掉，连续做一星期螨虫数量大大减少。
二、大肚子病
土元生长期内经常出现圆长、虫体上背发光发亮，腹部鼓胀，行动缓慢，用手挤压腹部易破，有黄色脓水流出，生长较慢，不交配不产卵，有部分死亡的病体土元。
本病防为主，更换潮湿的饲养土，打开门窗通风换气，使养殖池内空气新鲜，精饲料多一点，少喂青饲料，在饲料中配制2%的氯霉素，如病体虫达到大虫标准，可拣出制成干品出售。
三、天敌
土元的天敌较多，如鼠、蚂蚁、蜘蛛、鸡、鸭、猫……都能危害土元，所以建造饲养室要密封，防止有天敌进入。
四、蚂蚁的防治方法
饲养室内蚂蚁危害幼虫严重，可以用肉食类残渣涂蜜糖诱杀，新药蟑蚁净对蚂蚁有致命的杀灭作用。把蟑蚁净粉末放在蚂蚁出入的地方，蚂蚁马上拖入洞中，一星期左右一窝蚂蚁死光。
五、蜘蛛的防治
土元饲养房内一年四季如春，很适合蜘蛛生长繁殖。四周墙角、底层池顶部都是蜘蛛喜欢的地方。防治方法：一般采用人工捕捉，大规模养殖场都配有吸尘机，用吸尘机一星期吸一次，连续几星期基本上能把蜘蛛吸光，一般不用什么药物，以免引起土元误食。
六、农药
饲喂土元时青饲料一定要当心，防治有农药污染的饲料，盛装精饲料的蛇皮袋、器具都要避开、远离农药，一般农药对土元有致命能力，蚊香、灭蚊剂严禁使用。