随着学科体系改革的有序推进，南机所平台建设取得重大发展。在农业部“现代农业产业技术体系建设”中，建有油菜机械功能实验室和花生机械功能实验室，设有油菜、花生、茶叶、麻类、食用菌等数名科学家岗位。农业部农业机械重点开放实验室、农业部南方种子加工工程技术中心、江苏省农作物机械化收获装备工程技术研究中心、南京市农业机械工程技术研究中心、中国农业科学院农业机械野外科学观测试验站、国家植保机械质量监督检验中心、机械工业耕作机械产品质量检测中心、机械工业茶叶加工机械产品质量监督检测中心、旋耕机械行业分会等挂靠南机所。在充分发挥国家农机工程技术中心作用的同时，南机所通过整合农机、农艺行业的优势科技资源和产业优势人才，着力构建现代农机行业产学研结合的技术创新体系，联合共建现代农业装备与技术协同创新中心，完成了“数字化三维设计系统”、“数字高速摄影系统”、“多功能土槽试验台”、“土壤采样系统”和“现代照排系统”等一批条件建设项目，加入生物燃气、麻产业等科技创新战略联盟，并设有博士后科研工作站。高素质的人才队伍、完善的研发条件和高端制造能力的产业化基地，南机所研究实验能力与水平大大提高，并逐渐成为行业先进生产能力的代表。

十年前，南机所把大量的科研力量集中在主要农作物的关键生产环节上，而放在经济作物、渔业、林果业、设施农业等领域及农产品产前、产后加工作业环节上的研发工作能力则较为薄弱。十年来，南机所的科研重心也发生了改变，高地隙自走式茶园多功能管理机已在江苏、山东、浙江、安徽等八省试验示范，得到茶叶专家首肯。研究开发的国内首台乘坐自走式全自动采茶机日前完成了样机试验，并取得成功，该机具成功解决了单人和双人抬式采茶机需背负人抬、劳动强度大、工耗多等难题。4HLB-2型挖拔组合半喂入式花生联合收获机及4H-1500型和4H-800型两种分段收获模式下的花生收获机从种植制度、作业模式、共性技术及关键部件研究入手，重点攻克花生机械化收获中存在的壅土阻塞、秧蔓缠绕、损失率高、适应性差等关键技术难题，三种设备的研制成功不仅为加快我国花生机械化收获发展提供了有效技术支撑，亦为促进大蒜、洋葱和胡萝卜等浅土型根茎类作物联合收获技术发展与装备开发奠定了良好基础。注重区域发展平衡是“十一五”期间我国农机科研的一大发展特点。近年来，南机所将越来越多的科研目光投向了适宜多种地形条件作业的小型农机具，积极探索山区丘陵农机化的作业模式、技术路线和发展道路。

十年跨越，十年发展。南机所既是我国农机化事业发展的受惠者，又是发展成果的分享者。在协助农业部农业机械化管理司履行农机化教育培训职能、提供行业服务和促进科技兴农等方面，南机所发挥了国家级农机科研机构应有的公益作用。围绕农业生产最关键、行业发展最紧急、市场需求最迫切的中心问题广泛开展科技服务“三农”活动，积极参与农机培训。近年来成功举办“全国中高级农机化管理人才”、“全国农机合作社负责人与农机大户”、“全国水稻生产全程机械化技术培训班”“全国花生种植机械化技术培训班”等。2012年重点以做好三“结对”、办好一热线、建好三平台为主题内容的“农机313工程”。深入开展大联合、大协作，推进农机科技快速进园、到社、入户，提高技术入户率和到位率。力争年底前主推技术10项，指导10个示范园区，技术合作10个企业，指导20个专业合作社，培训1千名农机作业服务人员、合作社管理人员和科技示范户，辐射带动10万农户。国家植保检测中心完成了对植物保护机械产品国家级、省级监督抽查、市场监测检验、推广鉴定及企业委托检验任务，并提供上百次专家咨询，深入实施科技兴农工作。

《中国农机化》、《中国农机化年鉴》、《农业装备与开发》为国内外从事农业工程和农业机械化研究的科技工作者以及高等院校师生提供学术交流平台，在推动我国农业机械化新理论、新技术、新产品、新工艺的推广应用和促进出人才、出成果、出效益方面做出了积极贡献。