灌溉水质了解灌溉水的硬度和酸碱度，避免产生沉淀，降低肥效。如果灌溉水pH值大于7.0，表明水偏碱性，可能会造成水溶性肥料中铵态氮的挥发损失。国外的做法是在灌溉水中溶解一定数量的硫酸，将水调整到微酸性。如果水的硬度大，含钙镁高，加上水偏碱性，当施用水溶性磷肥时，可能会产生磷酸钙盐沉淀，这种沉淀一般过滤器不能过滤掉，肉眼也不方便观察到，微细的沉淀颗粒通过过滤器进入滴灌管道，慢慢沉积在滴头的流道内，累积到一定程度，堵塞滴头。这是很多盐碱土地区滴头堵塞的原因之一。同时磷酸盐沉淀也是降低水溶性肥中磷肥效果的重要原因。针对这种情况，建议采用酸性肥料，如磷酸尿素、硫酸尿素、酸性水溶性肥等。

    与其他肥料配合施用通常水溶性肥料只做追肥。在推荐施肥时，应基肥与追肥结合，有机肥与无机肥结合，水溶性肥与常规肥结合。不要强调水溶性肥代替其他肥，而要配合使用，降低成本，发挥各种肥料的优势。通常基肥施用有机肥、磷肥、镁肥等，追肥用水溶性肥，少量多次施用。在发达国家水溶性肥（包括液体肥）是常规肥料，价格适宜，追肥一般全程用水溶性肥。

    无机水溶性肥料与有机水溶性肥料配合施用现在常用的有机水溶性肥料有氨基酸、黄腐植酸、海藻多糖等。这些物质有刺激根系生长，螯合金属微量元素，提高作物抗逆性等功能。当两者配合施用会显著促进养分吸收，提高肥料利用效率。