消毒工作是疾病综合防治中的一个重要环节，只有通过科学、合理、有效的消毒，切断传染病的传播途径，才能减少或避免传染病的发生。目前，很多养禽场（户）消毒意识很强，消毒工作天天都在进行，但是能够真正做到科学消毒的并不是很多，往往只是跟从和模仿，消毒的效果并不理想。搞好科学消毒灭源工作要从以下四方面入手：
　　1. 选择合适的消毒药品
　　 消毒的效果与使用的消毒剂有直接关系，许多消毒剂都有自己的优缺点，如广泛使用的季铵盐类消毒剂虽然有很强的杀菌能力，但对病毒的杀灭能力很弱。目前除传统使用的消毒药外，新型消毒药大量面市，商品名称更是五花八门，许多养禽场由于不清楚什么消毒剂能杀灭什么样的病原，往往在选择时只看商品说明，而不看消毒剂的主要成分，很容易被夸大的商品说明误导。因此，在选用消毒药时一定要看清楚其主要成分。常用化学消毒剂的性能见下表：
　　 各个养禽场应本着“高效、经济和人禽无害”的原则并结合自场和周边疫病流行情况，选择适合的消毒剂。另外，长期使用单一消毒剂，细菌、病毒等病原易产生耐药性，各个养禽场最好选几种不同类型的消毒剂定期轮换使用，以达到良好的消毒效果。
　　2. 消毒前认真搞好环境卫生
　　养禽场往往存在大量的有机物，其中藏匿着大量病原微生物，会消耗或中和消毒剂的有效成分，严重降低消毒剂的作用，彻底清除这些有机物是有效消毒的前提。因此，养禽场在全面消毒前一定要将需要消毒的环境或物品清理干净，对所有的圈舍、周围环境等先进行一次大清扫，并将清扫的粪便、饲料粉渣、（）污物堆积后用泥土封好发酵。堆封表面可用2%氢氧化钠溶液喷洒消毒。
　　3. 掌握科学的消毒方法
　　①抓好消毒管理。科学合理的消毒管理，是消毒灭源的保证，养禽场应根据自场情况制定消毒制度并严格执行。
　　②做好禽舍消毒。在搞好禽舍环境卫生的基础上，对禽舍全面消毒。空置禽舍可先用消毒药对圈舍地面、墙壁进行喷洒或涂刷，再用福尔马林和高锰酸钾熏蒸消毒。带禽消毒时，可用通风、辐射等方法减少或杀灭舍内空气中的微生物。
　　③搞好环境消毒。禽舍的周围环境消毒至关重要，直接影响到禽的健康和公共卫生。要做好周围环境消毒：首先，场四周应设围墙或栅栏与外界隔离开。生产区出入口要设消毒池，池内灌满消毒液，并经常更换，深度为25～30厘米，铺上消毒垫以供消毒鞋底并经常保持湿润状态。其次，养禽场使用的料槽、运输车辆等所有器具均要消毒，场内物品要根据使用情况适时消毒，运输工具在出入场前要逐一消毒。再次，由于堆粪场是细菌、病毒、寄生虫易滋生的地方，所以粪便要及时清理并做好消毒处理工作。最后，为了避免传播病原，养禽场管理和饲养人员除了定期进行体检外，还要搞好个人卫生，在生产前后要勤洗手、勤消毒，养成每次进入养禽场之前更衣、换鞋并进行消毒的习惯，进入养禽场生产区要做到各司其职、不乱串岗。
　　4. 正确使用消毒剂
　　①消毒剂浓度要合理。消毒浓度是决定消毒剂杀菌（毒）力的首要因素，但不是惟一因素，也不是浓度越高越好，如浓度96%以上酒精不如70%酒精的杀菌效果好。实际生产中，要根据不同的消毒对象和消毒目的选择不同的消毒剂和消毒浓度。如圈舍环境消毒时可用1∶400百毒杀溶液喷雾，浓度低则达不到消毒效果，而进行消化道消毒时则要用1∶10000百毒杀溶液，否则会损伤动物机体。
　　 ②消毒剂量要得当。有时虽然消毒浓度够了，但在使用时常常忽视消毒药的用量。如果使用的剂量不够，就存在消毒的盲区，消毒效力就不均匀，只能是不完全的消毒。所以，在保证消毒浓度合理的同时，还应充分地润湿被消毒的物体，这样才能保证消毒效果。
　　③消毒频率要合理。在正常生产状态下，养禽场环境以3～5天消毒1次为宜，而在发病或受疫病威胁时，则须每天消毒。如果消毒次数和消毒强度不够，不能有效减少和控制饲养环境中病原微生物的数量，就有可能暴发疫病。
　　④消毒环境湿度要适宜。不同的消毒方法对环境湿度要求不同，如紫外线在相对湿度60%以下时杀菌力较强，相对湿度升为80%～90%时杀菌力会下降30%～40%，这是因为相对湿度增高会影响紫外线的穿透力；利用甲醛、过氧乙酸进行熏蒸消毒时，要求环境湿度在60%～80%，过高或过低都会影响消毒效果，甚至导致消毒失败。