稻秆对生育影响最明显的时候是在生育初期，春天气温低， 秸秆分解慢，由于微生物的活动要利用土壤中大量氮素，氮素供应不足就会出现微生物与作物争氮现象。在生长前期供氮充足是水稻正常生长和高产的基础，插秧返青后必须补氮。

植保。稻秆还田，使用化学除草剂，特别是进行土壤处理的化学除草剂的有效使用量应适当提高。由于秸秆还田促进了土壤微生物学活性强度，从而加快了除草药剂在土壤中的降解速度、缩短了药剂的残效期。稻草还田土壤有机质将逐渐提高，土壤处理的一些化学除草剂的有效剂量，应随着土壤有机质含量的提高适当增大。