池塘清整时，先将亲鳄龟池的池水排干，清除过多淤泥，填好池埂漏洞和裂缝，晒塘数日，再用药物清塘。常用的清塘药物有生石灰、茶粕、漂白粉、漂白精、三氯异氰尿酸等。
　　1 .生石灰清塘生石灰遇水会生成强碱性的氢氧化钙，使池水的pH 急剧上升到11-12 ，因此可杀灭野杂鱼类、敌害生物和各种病原体。使用生石灰清塘有干法和带水两种方法：
　　（ 1 ）干法清塘：排水至池中积水5-10 厘米深。在塘底挖若千个小坑，将生石灰分别放入小坑中加水融化，不待冷却即向池中均匀泼洒。生石灰用量一般每667 平方米为60-75 千克，淤泥较少的池塘用50-60 千克。清塘后第二天必须用铁耙耙动塘泥，使石灰浆与淤泥充分混合。
　　（ 2 ）带水清塘：即池水不排出，将融化好的生石灰浆全池泼洒。每667 平方米平均水深1 米用生石灰125-150 千克。由于带水清塘生石灰用量多，泼洒麻烦，故此法在生产上较少采用。
　　生石灰清塘的技术关键是所用的石灰必须是块灰，只有块灰才是氧化钙，才叫生石灰；而粉灰是生石灰潮解后与空气中的二氧化碳结合形成碳酸钙，称为熟石灰，不能作为清塘药物。
　　2 .茶粕清塘茶粕是油茶的种子经榨油后所剩余渣滓，压成圆饼状。茶粕含7%-8%的皂角昔，它是一种溶血性毒素。浓度为十万分之一的皂角苷，9-10 小时就使鱼失去平衡，11 小时鱼即死亡。
　　将茶粕敲成小块或用粉碎机粉碎，加水浸泡。在水温25 ℃ 左右浸泡一昼夜即可使用。施用时再加水，均匀泼洒于全池。每667 平方米池塘水深20 厘米用量为13 千克，水深1 米用35-45 千克。上述用量可视池内野杂鱼的种类而增减。对不能钻泥的鱼类，用量可少些，反之则多些。
　　3 .漂白粉、漂粉精、三氯异氰尿酸清塘这三种药物遇水都分解，释放出次氯酸，次氯酸立即释放初生态氧，它有强烈的杀菌和杀灭敌害生物的作用。漂白粉通常含有效氯30 ％左右（这是指具有消毒能力的氯占总量的百分比）；漂粉精是纯次氯酸，含有效氯60 ％-70 % ，三氯异氰尿酸含有效氯85 ％-90 ％。
　　先计算池水体积，漂白粉每立方米水体用20 克，即百万分之二十（20*0.000006） ，漂粉精用量为漂白粉的1 / 2 （ 10*0.000006） ，而三氯异氰尿酸用量则为漂白粉的1 / 3 （约7*0.000006）。将它们加水溶解后，立即全池泼洒。漂白粉清塘的技术关键是务必防止其吸水潮解。漂白粉一经潮解，其有效氯含量大大下降，影响清塘效果。而漂粉精性质较稳定，三氯异氰尿酸性质最为稳定，如敞开存放半年，其有效氯的损失也不到10 ％。
　　采用上述药物，一般需经7-10 天后药性消失，方可放养亲鳄龟。漂白粉类的药物其药性消失较快，通常清塘5 天后即可放养亲鳄龟。
　　上述几种药物的效果各有特点。茶粕能杀灭鱼类、水生昆虫、蛙卵、蝌蚪、螺蛳、蚂蟥等。生石灰、漂白粉、漂粉精和三氯异氰尿酸除杀灭上述敌害生物外，还能杀灭水草、丝状藻类、寄生虫和致病菌等，其清除敌害的作用迅速而彻底。生石灰还能保持水中pH 稳定，释放出被淤泥吸附的氮、磷、钾等营养物质，改善水质。必须强调的是，盐碱地鱼池，池水碱性大，pH 高，因此不宜再选用碱性强的生石灰作为清塘药物，而应当选用漂白粉类的药物。此外，茶粕中的溶血性毒素对动物血液中的红细胞有强烈的破坏作用，而虾、蟹等甲壳类的血液不呈红色（是蓝血球），它们对溶血性毒素的敏感度比鱼类低50 倍。因此通常用茶粕清塘。其药物的剂量只能杀灭鱼类等带有红细胞的动物，而对虾蟹类则不起作用，故茶粕清塘有虾蟹越清越多之说。
　　（二）种龟的合理放养
　　合理的放养密度可避免亲鳄龟争食、争配偶而发生残斗，还可以保持良好水质，有利于鳄龟的交配产卵和亲鳄龟的生长育肥，也为减少和防止鳄龟患病创造了有利条件。亲鳄龟的放养密度根据个体大小而定，通常个体4-5 千克每667 平方米放养重量控制在300 千克左右，以每8-10 平方米放一只为宜，最大不超过100 只。雌，雄比例为3：1。
　　同池个体大小悬殊的亲鳄龟应分池饲养。亲鳄龟池可搭配鳞、缩等滤食性鱼类，但放养量每平方米不超过1 尾。亲鳄龟池通常为常温露天池饲养，由于它在夏季产卵，冬季来临时要进行冬眠，因此亲鳄龟放养主要在4 月前和工。月后，水温在15-17 ℃ 时放养。在此水温条件下亲鳄龟一般不吃食或吃食量很少。可利用这段时间使其对新环境有一个适应过程，当进人冬眠时亲鳄龟可完全潜入泥沙中越冬。如在水温较低时进行亲鳄龟放养，此时其新陈代谢低，入水后已无力潜入泥沙中，严冬来临时会造成大量死亡。