沼气池使用的好坏与日常管理关系很大，常言道“三分建池，七分管理”，沼气池的管理应做到“四勤”，即勤进料、勤出料、勤搅拌和勤检查。
一要经常进出料
为保证沼气细菌有充足的食物和进行正常的新陈代谢，使产气正常而持久，就要不断地补充新鲜的发酵原料、更换部分旧料，做到勤加料、勤出料。
1.进出料的数量。
不搞养殖的户，在沼气池启动后，加新料一般在启动一个月后，每周加新料，出旧料，每次加料量占发酵料液的3%-5%，也就是平常用的小推车一车。另一种情况是在沼气上边搞养殖的户，如果有存栏3-4头猪，或1-2头牛，再加上人粪尿入池发酵，就可以满足一个沼气池日常产气需要。
2.平时进、出料应注意的问题。
⑴原则上是出多少进多少、顺序为先出后进；
⑵出料时应使剩下的料液液面不低于进料管和出料管的下口上沿，以免池内沼气从进料管和出料管跑掉；
⑶出料后要及时补充新料，若一次发酵原料不足，可加入一定数量的水，以保持原有水位，使池内沼气具有一定的压力。
3.大换料应注意的问题。为满足沼气菌的新陈代谢和农田季节用肥的需要，一般大换料的时间安排在春季和秋季进行。
⑴大换料前20-30天，应停止进料，以免浪费发酵原料。
⑵大出料后应及时加足新料，使沼气池能很快重新产气和使用。
⑶大出料时应清除沼气池内的全部残渣和部分料液，要留下10%-30%以活性污泥为主的料液作为接种物，以加快沼气的启动，做到产气快。
⑷大换料不要在低温季节进行，当地温、气温在10℃以下时不能大换料，因为低温下沼气池很难启动。
二 要经常搅拌。这是提高产气率的一项重要措施。如不经常搅拌，就会使池内浮渣层形成很厚的结壳，阻止下层产生的沼气进入气箱，降低产气量。农村家用池一般没有安装搅拌装置，可用下面两种方法：
1、从进料口搅拌；
2、从出料间掏出数桶发酵液，再从进料口将发酵液冲到池内，也起到搅拌池内发酵原料的作用。
三 要经常测定和调节发酵液的PH值。沼气细菌适宜在中性或微碱性环境条件下生长繁殖（PH6.8-7.5），酸碱性强（PH小于6.5或大于8）都对沼气细菌活动不利，使产气率下降，为加速产气可采取以下调整措施：
1、加入适量的草木灰；
2、取出部分发酵原料，补充相等数量或稍多一些的含氮发酵原料和水；
3、将人、畜粪尿拌入草木灰，一同加到沼气池内；
4、加入适量的石灰水，但不能加入石灰，而是加入石灰水的澄清液。同时还要把加入池内的澄清液与发酵液混合均匀，避免强碱对沼气细菌活动的破坏。
四 控制发酵料液浓度。沼气池内的发酵原料必须有适量的水分，才有利于沼气细菌的正常生活和沼气生产，水分过多过少都不利于沼气细菌活动和沼气的产生，水少发酵液浓度过高，容易积累大量有机酸，发酵原料的上层就容易结成硬壳，使沼气发酵受阻。浓度过低，发酵液中干物质含量少，沼气细菌会饿死。沼气池适宜的发酵浓度应该控制在6%-10%，夏秋季节温度高，发酵浓度可低一些为
6%-8%，冬春季节温度较低，发酵浓度应高一些为8%-10%。
五 做好沼气池的越冬保温工作。一是要多进料、勤进料，适当提高料液浓度；二是多进热性发酵原料，如牛粪、鸡鸭粪等，有条件的地方可进些酒槽水、豆腐水等；三是对于太阳能采暖保温畜禽舍的沼气池，入冬前要及时加盖棉被或草帘。如果是露天沼气池，应在主池上面堆放作物秸杆，厚度要超过冻土层厚度，宽度要大于池体周围1米，秸杆下面要垫50厘米如麦秸、树叶、玉米皮等软碎物质。
六 做好安全发酵。沼气池内细菌接触到有害物质时就会中毒，造成沼气池停止产气。对产气影响较大的有害物质主要有：
各种剧毒农药，有机杀菌剂、抗生素。
1.刚消过毒的畜禽粪便，如粪便在堆沤过程中，不要喷洒蚊蝇净等药剂。
2.电石、洗衣粉、粉衣服水不能入池。沼气池内细菌如果发生中毒，轻者将发酵料液取出一半，再投入一半新料。重者将料液全部清出，将池体清洗干净。