辣椒生长期长，产量高，见效快，采收期可以从初夏开始一直到初霜前。发展辣椒生产不仅可以调节市场，而且是调整种植业结构，帮助我县山区农民致富的一个好项目。但近年来随着栽培面积的逐年增大，病虫危害的损失也逐年增大。为减少损失，对危害辣椒的主要病虫害可采取如下有效的防治措施：
1．猝倒病：低温高湿时最易发病，病苗近地面茎基部呈水浸状，缢缩变细呈线条，子叶尚未凋萎，地上部因失去支撑能力而倒伏死亡。选用高效低毒、低残留农药，如：55%敌克松800倍液或50%甲基托布津1000-1500倍液或70%百菌清可湿性粉剂800倍液、58%雷多米尔可湿性粉剂500倍液喷雾。选择其中的任意一种，每间隔7-10天施药防治一次，连续防治2-3次。
2．立枯病：苗期主要病害，枯死的苗立而不倒，因此俗称"站着死"，育苗中后期高温高湿最易发生；药剂防治同猝倒病。
3.灰霉病：苗期和成株期均可发生。苗期苗床内播种过密导致幼苗徒长、抗病力弱，遇湿度较大时最易发生，可用50%速克灵可湿性粉剂1000-3000倍液、25%甲霜灵可湿性粉剂800-1000倍液等防治。选择其中的任意一种，每间隔7-10天施药防治一次，连续防治2-3次。
4.疫病：辣椒早疫病主要侵害叶片，叶上的病斑后期具同心轮纹，当空气湿度大时病斑上着生黑色的霉层。在苗期至成株期均可以危害。茎杆出现水浸、褐色病斑，病叶呈水浸状腐烂，叶片和果实迅速凋萎、脱落。病原菌靠水传播，发病速度快，所以雨水多的季节，湿度大的田块易发生，是辣椒生产上的毁灭性病害。药剂防治：58%雷多米尔可湿性粉剂500-1000倍液、72.2%普力克水剂600-800倍液、70%百德富可湿性粉剂500-700倍液. 25%甲霜灵可湿粉剂800-1000倍液等防治。选择其中的任意一种，每间隔7-10天施药防治一次，连续防治2-3次。
5.炭疽病：辣椒炭疽病是一种常见而且危害比较严重的病害，它主要侵害果实和叶片。果实在转色期高温高湿下最易发生。炭疽病是以病菌孢子或菌丝体附在种皮上越冬。病斑褐色，为不规则形圆斑，有同心轮纹，其上生有黑色小点。药剂防治：75%百菌清可湿性粉剂600倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂500-800倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500-600倍液。发现中心病株，立即喷施农药。选择其中的任意一种，每间隔7-10天施药防治一次，连续防治2-3次。
6. 白绢病：主要危害近地面的茎基部或根颈处。在潮显条件下病部及四周地表长出白色菌丝。由于茎部皮层腐烂，引起上部叶变黄，直至整株枯萎。发病条件为高温高湿，6-7月为发病高峰期。防治方法：地膜高畦栽培；做好田园清洁，清除越冬病残体；重病田块施石灰，改变土壤酸碱度（此病原菌喜酸性）；将病株及时拔除，并在穴四周撒石灰消毒；可用70%五氯硝基苯可湿性粉剂配成药土，撒在根颈周围。
7．病毒病：叶片部分失绿，形成花叶，严重时叶片皱缩、黄化、坏死、畸形；在高湿、干旱、日照过强时易发生；药剂防治：防治此病的重点是防治传毒媒介蚜虫为主，对已发生病毒病的田块可选用5%植病灵水剂300倍液、20%病毒A可湿性粉剂400-500倍液、菌毒清200-500倍液等。
8.地下害虫（如地老虎-地蚕、蛴螬等）：主要危害近地面的茎部，使整株死亡。⑴诱杀防治。一是黑光灯诱杀成虫；二是糖醋液诱杀成虫，糖6份、醋3份、白酒1份、90％敌百虫1份调匀，或用泡菜水加适量农药，均有诱杀效果。 ⑵化学防治。地老虎1-3龄幼虫期抗药性差，且暴露在寄主植物或地面上，是药剂防治的适期。可用21％增效氰马乳油8000倍液、2.5％溴氰菊酯或20％氰戊菊酯3000倍液、10％溴o马乳油2000倍液、90％敌百虫800倍液灌根防治。
9、蚜虫在辣椒上是吸植物汁液，造成叶片卷缩变形。它还传播病毒病，造成的危害更大，防治可用20%氰戊菊酯 1000-1500倍液或2.5%功夫乳油3000-4000倍液或2.5%天王星乳油300倍液或辟牙雾、一遍净、比虫林等喷雾。
10．钻心虫、青虫等：防治重点应在开花初期，选用的药剂有：2.5%功夫乳油4000倍液；2.5%天王星乳油3000倍液；BT乳剂500-1500倍液等。