巷道式孵化器内的温度实际存在由低到高然后由高到低的变化，所以在控制温度时应贯彻中间为主、入端为辅的原则，入端控温在37.9-38.1，中间不能超过38
3，中间为从入端开始第三车的孵化温度。
1、孵化室内的通风要求。孵化室内最好为负压通风，这样有利于室内废气的排出，外界对孵化室内环境的影响较小。资料证明，通风量的大小不会影响胚胎的发育，20台巷道式孵化器的孵化室内用一台370W的风机就能够保证排出孵化器内的废气，所以孵化室内应在保证温度的前提下进行通风。
2、孵化过程中温度的调节。孵化中一般不要轻易改变温度．要以平稳为主，大范围的调温应根据不同季节、受精率变化、种蛋日龄的变化进行调整，每次调整范隔最大不应超过O.1。在落完盘后，温度设定必须上调，上调幅度以上次落盘温度为准，以便孵化器内的温度迅速恢复到所要求的标准温度。每次上调幅度不应超过0.3。