一、易造成环境的恶化
目前对肉用种鸡进行限饲通常采用数量限饲，即通过控制饲喂数量来限制鸡对蛋白质和能量的摄入量。在这种情况下，因鸡的采食量受到了控制，一半左右的鸡便对饮水发生兴趣，大量的饮水及颈部羽毛带出来的水很容易导致舍内垫料的潮湿。粪便在高湿度的条件下发酵产生氨气、硫化氢等有害气体，如果通风不良，这些有害气体蓄积，造成了环境的恶化。鸡群在这种环境中，防御屏障遭到了破坏，对疾病的抵抗力降低，对新城疫、霉形体等传染病的感染力提高。潮湿的热料还是寄生虫卵繁殖发育的场所，因此，应做好环境的控制。（1）对鸡群进行限水，除高温季节外，喂料日喂料前1小时供水，至料吃完后1小时停水，不喂料日分三次供水，每次1小时。（2）注意通风，勤降垫料，不使粪便过多蓄积而发酵。（3）加强管理，保持鸡群健康，避免拉稀，可在饲料中适当添加一些抗菌保健药物。
二、引发营养缺乏症
对限饲阶段的种鸡，如果仍然按常规浓度添加维生素、矿物质等鸡生长发育的必要成份进行饲喂，因采食量不足，必然引起一些必需物质的摄入减少，时间一长即可引起一系列的营养缺乏症。常见的有营养性瘫痪、神经症状、啄癖、生长不良等，在鸡受到应激时表现更明显。针对这种情况，在配制育成期种鸡饲料时一定要注意以下几点：（1）选用优质添加剂。（2）增加添加剂用量，如维生素的用量可在正常基础上增加30％。（3）饲料现配现用。（4）有应激时维生素、矿物质的用量加倍。
三、药物使用效果降低
一般药物的使用量范围是根据鸡的正常采食量等因素推算而来，限饲期如果按正常的药物使用浓度将药物添加剂加到饲料中，因采食量减少导臻药物吸收量减少，使药物的治疗和预防作用发挥不了，引起某些疾病的发生。育成期种鸡在采用限制饲喂后球虫病的多发和难控制很大程度上与之有关。因此在使用饲料抖服的药物时，使用量应在正常基础上增加30％，或将限制饲喂临时改为自由采食，以保证鸡摄入足量的药物。
四、抢食造成鸡群压死胀死
限饲期种鸡在食后时间较长时往往表现出较强烈的饥饿感，尤其是不喂料日。每当再次饲喂时，在开始的短时间内鸡群为了及早抢到食便会朝一处聚集，如不及时驱散便会发生种鸡压死，同时喂饲时部分鸡会因抢食而食入过多，在不能及时饮上水时便容易噎死。因此，喂饲时要力求速度快，在短时间内将饲料喂完，并尽量在不见光时饲喂，喂料之前供应好充足的饮水，且水源离食槽不要太远。这样可避免压死胀死现象的发生。