辣椒发生菌核病的防治方法：用25%多菌灵可湿性粉剂，每平方米用10克，拌细干土1千克撒在土表进行土壤消毒。也可用40%福尔马林，每平方米用药20至30毫升，加水2.5至3千克均匀喷洒地面，充分拌匀后堆置，用潮湿的草帘或薄膜覆盖，闷2至3天，以充分杀菌。然后揭开覆盖物，把土壤摊开，晾15至20天，待药气散发后，再进行播种或定植。药剂防治可选用50％多菌灵可湿性粉剂800至1000倍液，或50%速克灵1500至2000倍液。连用2至3次。