减少初侵染菌源量的措施，主要是将稻草、稻谷壳集中作为燃料或坑制、堆制肥料。经过沤制，杀死越冬病菌，减少初侵染菌源。肥坑内病稻草上的病菌存活时间约为14天，病草堆肥经4个月病菌也能全部死亡，故以坑制肥料灭菌效果更好。育苗时要搞好种子的药剂处理，杀灭种子上所带病菌，拔秧苗时禁止使用稻草捆秧，也是减少初侵染菌量的有效措施之一。

    此外根据地力情况，中等肥力田块一般亩施标氮（硫铵）60kg，二铵10kg，钾肥7～10kg锌肥1.0～1.5kg。

    禁忌过多、过晚施用氮肥，注意增施磷、钾肥，做到配方施用，确保氮、磷、钾肥平衡，同时要无机肥与有机肥结合，有机肥要进行腐熟化处理。

    药剂防治应抓住关键时期-抽穗前期即破口期，一般在7月下旬，喷施富士一号、灭稻瘟一号或三环唑等药剂均可有效防治穗颈瘟的流行；如在8月上旬仍发现病穗，可于齐穗期重复施药一次。