多年观察和试验证明，棉花黄萎病发病最适气温为25。～28。C，低于22。C或高于33。C不利于发病，超过35。C不表现症状。据报道：棉田土温15。C时，黄萎病发病率为58%，当土温为20。C、25。C、30。C时，发病率分别为75%、85%和59%，当土温达35。C时，棉株无症状表现。高湿也适于黄萎病发生，当相对湿度为55%时，发病株率65%，相对湿度65%时，发病株率上升为70%。在适宜温度与高湿相结合的环境下，病株率迅速增长。多雨年份，月降雨量在150毫米以上，雨日为20天左右，相对湿度80%，是黄萎病爆发的有利因素。

　　2、与棉花品种的关系：不同的棉花品种在相同环境条件下，感染黄萎病的程度不同，一般海岛棉抗病性强，陆地棉感病者居多，中棉普遍易感病。陆地棉品种不同，抗、感黄萎病差异明显。近年国内育成一批耐黄萎病的棉花品种，使棉花黄萎病的为害得到抑制或缓解，但棉花黄萎病菌有高度变异性，很易受生态环境的影响而产生新的生理类型，使棉花品种丧失抗病性。所以要求不断地培育出更好的兼抗棉花枯、黄萎病的新品种，配合耕作栽培技术措施，达到更有效地控制病害的目的。

　　3、与耕作栽培的关系：陕西曾调查连作3年、6年和9年的棉田，黄萎病株率依次为14.4%、23.3%和27.5%；新疆石河子在纯黄萎病区调查，连作3年、4年和5年的棉田，黄萎病病情指数分别为8.8、20.7和32.8。采用和水稻、小麦、玉米轮作，病害明显减轻，轮作年限越长防治效果越好。地势低洼、排水不畅的棉田发病较重，尤其是大水漫灌，一方面携带病菌传播，另一方面土壤含水量过高，影响棉花根系功能，利于病害蔓延。营养失调也促进发病，如偏施或重施氮肥；增施磷、钾肥利于增强棉株抗病能力。